More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0895 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0895  bifunctional short chain isoprenyl diphosphate synthase  100 
 
 		 297 aa  598  1e-170  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224244  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1389  polyprenyl synthetase family protein  61.28 
 
 		 297 aa  362  5.0000000000000005e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0566  polyprenyl synthetase family protein  61.28 
 
 		 297 aa  358  4e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.293627  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0645  polyprenyl synthetase family protein  61.28 
 
 		 297 aa  358  4e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0989219  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0687  polyprenyl synthetase  60.61 
 
 		 294 aa  347  1e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.169435  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0763  prenyl transferase  60.61 
 
 		 297 aa  347  1e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00222564  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0771  polyprenyl-diphosphate synthase  59.26 
 
 		 297 aa  331  1e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1327  Polyprenyl synthetase  54.55 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000397388  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0858  polyprenyl synthetase  50.84 
 
 		 295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.271141  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  35.58 
 
 		 334 aa  169  7e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  35.36 
 
 		 334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  36.6 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  36.44 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  34.29 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  35.19 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  34.27 
 
 		 324 aa  157  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  36.04 
 
 		 317 aa  157  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  40.18 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  42.79 
 
 		 333 aa  156  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  37.44 
 
 		 322 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  39.71 
 
 		 322 aa  155  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 337 aa  155  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  31.79 
 
 		 322 aa  155  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  35.11 
 
 		 342 aa  155  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  33.69 
 
 		 323 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  31.91 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  41.29 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.14 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  39.8 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  32.97 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  34.36 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0858  solanesyl diphosphate synthase  33.67 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0128707  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3450  Polyprenyl synthetase  42.46 
 
 		 330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024256  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  40.2 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0506  octylprenyl-diphosphate synthase  42.46 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282953  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  33.69 
 
 		 323 aa  152  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  35.13 
 
 		 324 aa  152  5e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  33.8 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  33.69 
 
 		 344 aa  152  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  38 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  37.05 
 
 		 327 aa  152  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2658  Polyprenyl synthetase  40.64 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0590185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  34.39 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  41.04 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  35.85 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  34.56 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  35.95 
 
 		 359 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  31.91 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  33.46 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  31.34 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5924  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.48 
 
 		 323 aa  149  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  34.75 
 
 		 323 aa  149  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  36.24 
 
 		 327 aa  149  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  36.53 
 
 		 322 aa  149  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  31.9 
 
 		 331 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  31.9 
 
 		 331 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  31.9 
 
 		 331 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  32.95 
 
 		 337 aa  149  7e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  31.9 
 
 		 331 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  39.22 
 
 		 345 aa  149  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  32.39 
 
 		 326 aa  149  8e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  32.63 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  32.54 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  33.96 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  33.1 
 
 		 358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2517  Polyprenyl synthetase  36.61 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  33.45 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2899  octaprenyl-diphosphate synthase  36.61 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  41.38 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  32.67 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.29 
 
 		 320 aa  146  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  32.66 
 
 		 323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0912  Polyprenyl synthetase  41.31 
 
 		 312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0418451  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  33.85 
 
 		 338 aa  146  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  32.62 
 
 		 336 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  35.09 
 
 		 320 aa  145  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  34.16 
 
 		 313 aa  145  9e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  30 
 
 		 323 aa  145  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 340 aa  145  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  33.7 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.97 
 
 		 324 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  31.88 
 
 		 336 aa  144  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  37.62 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  32.25 
 
 		 336 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  31.29 
 
 		 348 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  32.61 
 
 		 336 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  29.64 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  29.64 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  29.64 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  29.64 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  29.54 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  34.84 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  29.64 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  29.64 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  33.59 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  33.1 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  30.28 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  33.58 
 
 		 335 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  29.64 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 340 aa  143  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>