More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3242 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_3242  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 354 aa  717    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.650754  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0319  octaprenyl-diphosphate synthase  34.51 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00046336  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.65 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1537  polyprenyl synthetase family protein  32.84 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  36.72 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.63 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  31.75 
 
 		 349 aa  139  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  33.67 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  34.23 
 
 		 317 aa  132  9e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  33.89 
 
 		 317 aa  132  9e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  31.37 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  31.13 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  33.22 
 
 		 317 aa  129  6e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  29.97 
 
 		 347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  30.64 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  29.96 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  30.51 
 
 		 343 aa  122  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  32.89 
 
 		 349 aa  122  7e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2956  Polyprenyl synthetase  32.46 
 
 		 308 aa  122  9e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.660662  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  29.97 
 
 		 342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  29.59 
 
 		 327 aa  119  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0295  trans-hexaprenyltranstransferase  32.79 
 
 		 331 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  30.16 
 
 		 321 aa  119  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.17 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  27.18 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  27.91 
 
 		 348 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  28.21 
 
 		 324 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  32.07 
 
 		 348 aa  116  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  26.6 
 
 		 323 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  30.1 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  26.6 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0016  Polyprenyl synthetase  30.89 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24479 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  28.76 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  28.09 
 
 		 331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  27.96 
 
 		 323 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4923  Polyprenyl synthetase  31.75 
 
 		 768 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0645809  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01592  conserved hypothetical protein  31.25 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  27.97 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  28.85 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1618  polyprenyl synthetase  32.76 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.399283 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0534  trans-hexaprenyltranstransferase  32.87 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4051  polyprenyl synthetase  33 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.21 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2351  polyprenyl synthetase  31.22 
 
 		 386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.777136 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  29.6 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2538  Dimethylallyltranstransferase  30.99 
 
 		 349 aa  109  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  28.88 
 
 		 337 aa  109  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2312  polyprenyl synthetase  32.35 
 
 		 386 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2359  polyprenyl synthetase  32.35 
 
 		 386 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.852076  normal  0.554984 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  30.15 
 
 		 332 aa  109  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  27 
 
 		 323 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  27.34 
 
 		 322 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  29.5 
 
 		 322 aa  109  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  28.96 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47271  predicted protein  31.28 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  29.1 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  29.69 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  28.66 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  26.76 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0181  polyprenyl synthetase  29.9 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.375352 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  25.58 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  27.25 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  27.65 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  30.26 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  30.07 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  30.31 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  28.62 
 
 		 333 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  27.8 
 
 		 313 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.46 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  25.84 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  29.94 
 
 		 327 aa  107  5e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00654  Geranylgeranyl diphosphate synthase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874I1]  32.14 
 
 		 396 aa  106  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.371753 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  30.69 
 
 		 336 aa  106  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  28.28 
 
 		 333 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  27.85 
 
 		 322 aa  105  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  28.81 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.07 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  27.8 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  29.18 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4449  polyprenyl synthetase  32.78 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0447682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.8 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2899  octaprenyl-diphosphate synthase  29.24 
 
 		 322 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  26.6 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  28.9 
 
 		 322 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2517  Polyprenyl synthetase  29.24 
 
 		 322 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  30.13 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  26 
 
 		 323 aa  104  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  28.52 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  28.28 
 
 		 322 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  25.67 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  27.18 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  25.56 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2996  octaprenyl-diphosphate synthase  28.33 
 
 		 340 aa  103  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  27.38 
 
 		 345 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  25.93 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  26.69 
 
 		 324 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  30.08 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0658  polyprenyl synthetase  27.33 
 
 		 341 aa  103  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.586121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  26.79 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  30.56 
 
 		 333 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>