More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47271 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_47271  predicted protein  100 
 
 
330 aa  681    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00654  Geranylgeranyl diphosphate synthase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874I1]  53.01 
 
 
396 aa  290  3e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.371753 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00090  farnesyltranstransferase, putative  45.93 
 
 
322 aa  275  8e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08143  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase AtmG, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02400)  50.37 
 
 
355 aa  257  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.250061  normal  0.283251 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01592  conserved hypothetical protein  45.52 
 
 
397 aa  248  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108792  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06810  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01210)  42.91 
 
 
933 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.977304  normal  0.681153 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46658  geranylgeranyl diphosphate synthase  40.64 
 
 
347 aa  195  9e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.606185 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02407  conserved hypothetical protein  36.01 
 
 
675 aa  185  8e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.54872 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02611  geranylgeranyl diphosphate synthase, putative (JCVI)  37.8 
 
 
645 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221  normal  0.0772164 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0319  octaprenyl-diphosphate synthase  33.63 
 
 
347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00046336  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3242  Polyprenyl synthetase  31.28 
 
 
354 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.650754  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.35 
 
 
354 aa  103  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  32.75 
 
 
349 aa  101  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.56 
 
 
364 aa  99.4  8e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  32.09 
 
 
326 aa  97.1  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  27.78 
 
 
338 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1537  polyprenyl synthetase family protein  32.46 
 
 
350 aa  95.1  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  29.34 
 
 
317 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  29.34 
 
 
317 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  27.72 
 
 
317 aa  92.4  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  30.43 
 
 
317 aa  90.9  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  27.6 
 
 
327 aa  91.7  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  29.29 
 
 
317 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1618  polyprenyl synthetase  27.27 
 
 
329 aa  90.9  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.399283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  26.59 
 
 
338 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  27.78 
 
 
327 aa  88.2  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23090  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  28.63 
 
 
335 aa  86.7  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  26.85 
 
 
322 aa  86.7  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  28.94 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  26.87 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  28.94 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  27.82 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  25.44 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  28.04 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  28.32 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  27.21 
 
 
322 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0241  Polyprenyl synthetase  35.66 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.362047 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2956  Polyprenyl synthetase  28.67 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.660662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  26.86 
 
 
322 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  24.91 
 
 
322 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  25.64 
 
 
342 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  24.63 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  25.76 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  26.39 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  27.19 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  27.68 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  26.87 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301992 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  27.52 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5067  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.34 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  26.04 
 
 
324 aa  80.1  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2658  Polyprenyl synthetase  26.72 
 
 
325 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0590185  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  28.19 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  28.19 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  28.19 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  28.19 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  28.38 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  25.45 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  26.72 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2351  polyprenyl synthetase  30.95 
 
 
386 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.777136 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0752  trans-hexaprenyltranstransferase  25.69 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0130726 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1972  trans-hexaprenyltranstransferase  28.95 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  29.69 
 
 
343 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  25.76 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2312  polyprenyl synthetase  31.12 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  25.91 
 
 
323 aa  79  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2359  polyprenyl synthetase  31.12 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.852076  normal  0.554984 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  26.64 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4493  polyprenyl synthetase  27.56 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000291603  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  25.48 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  25 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  26.58 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  25.43 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  27.15 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0890  polyprenyl synthetase  26.85 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0253423 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  25.43 
 
 
323 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  23.55 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  28.25 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  24.66 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  24.33 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  27.21 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  27.11 
 
 
322 aa  76.6  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  24.33 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  24.14 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  25.36 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  25 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  26.99 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0658  polyprenyl synthetase  25.55 
 
 
341 aa  75.9  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.586121  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  24.33 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  26.73 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  26.52 
 
 
325 aa  75.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  24.78 
 
 
322 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  25.68 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  26.72 
 
 
370 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1389  polyprenyl synthetase family protein  27.6 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  23.79 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  26.72 
 
 
370 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  26.96 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  24.89 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  26.54 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  26.97 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.440008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>