More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_08143 on replicon BN001302
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_08143  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase AtmG, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02400)  100 
 
 
355 aa  734    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.250061  normal  0.283251 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00654  Geranylgeranyl diphosphate synthase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874I1]  54.29 
 
 
396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.371753 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01592  conserved hypothetical protein  47.7 
 
 
397 aa  277  2e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108792  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00090  farnesyltranstransferase, putative  48.75 
 
 
322 aa  267  2e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47271  predicted protein  48.81 
 
 
330 aa  263  3e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06810  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01210)  38.98 
 
 
933 aa  193  5e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.977304  normal  0.681153 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46658  geranylgeranyl diphosphate synthase  42.23 
 
 
347 aa  172  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.606185 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02407  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
675 aa  163  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.54872 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02611  geranylgeranyl diphosphate synthase, putative (JCVI)  39.69 
 
 
645 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221  normal  0.0772164 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3242  Polyprenyl synthetase  29.55 
 
 
354 aa  98.2  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.650754  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  31.69 
 
 
349 aa  97.1  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.76 
 
 
364 aa  96.3  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1537  polyprenyl synthetase family protein  34.66 
 
 
350 aa  95.5  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.27 
 
 
354 aa  91.3  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0319  octaprenyl-diphosphate synthase  26.64 
 
 
347 aa  88.2  2e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00046336  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  27.62 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  27.39 
 
 
317 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  27.8 
 
 
317 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  26.14 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  26.78 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  26.14 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  26.97 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  25.57 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  25.57 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  25.9 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  25.9 
 
 
322 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  25.25 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  27.78 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  25 
 
 
322 aa  77  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  27.52 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  26.87 
 
 
338 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5159  octaprenyl-diphosphate synthase  25.44 
 
 
322 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0320135  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  27.63 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  27.27 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  24.24 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2956  Polyprenyl synthetase  29 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.660662  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  23.1 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  27.72 
 
 
324 aa  73.2  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  28.32 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  27.91 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0890  polyprenyl synthetase  23.4 
 
 
309 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0253423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  25 
 
 
322 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  30.29 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  24.64 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  24.01 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  25.51 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  24.7 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  24.77 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  24.64 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  23.48 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  27.37 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5713  Geranyltranstransferase  25.89 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119458  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  26.95 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  30.5 
 
 
332 aa  69.3  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2996  octaprenyl-diphosphate synthase  24.82 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1268  Polyprenyl synthetase  25.62 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.635974 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  24.26 
 
 
323 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  24.37 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  25.32 
 
 
325 aa  68.9  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  23.95 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  26.58 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  23.76 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  26.49 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  24.34 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  26.04 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  26.79 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  23.85 
 
 
322 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  25.19 
 
 
322 aa  67.8  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  23.53 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4923  Polyprenyl synthetase  32 
 
 
768 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0645809  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  23.08 
 
 
359 aa  67.4  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  24.9 
 
 
322 aa  67  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  25 
 
 
347 aa  67  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  22.97 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  23.05 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  22.76 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  27.95 
 
 
322 aa  65.9  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  24.04 
 
 
356 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  24.25 
 
 
327 aa  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  24.9 
 
 
327 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  26.34 
 
 
337 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  25.2 
 
 
331 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  24.07 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  23.87 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4493  polyprenyl synthetase  26.69 
 
 
339 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000291603  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  25.45 
 
 
327 aa  65.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  24.2 
 
 
332 aa  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  22.39 
 
 
323 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  22.39 
 
 
323 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  22.39 
 
 
323 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  22.39 
 
 
323 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  22.39 
 
 
323 aa  65.1  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  22.39 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  22.18 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  22.18 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  22.39 
 
 
323 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  25.2 
 
 
331 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  22.99 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  25.2 
 
 
331 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  25.2 
 
 
331 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>