More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0890 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0890  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 309 aa  640    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0253423 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1574  octaprenyl-diphosphate synthase  83.12 
 
 		 349 aa  534  1e-151  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.836554 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1756  trans-hexaprenyltranstransferase  81.82 
 
 		 344 aa  528  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.726809  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  46.08 
 
 		 322 aa  275  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  45.78 
 
 		 322 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  45.78 
 
 		 322 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  43.41 
 
 		 323 aa  265  7e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  45.78 
 
 		 322 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  46.33 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  46.67 
 
 		 322 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  46 
 
 		 322 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  45.45 
 
 		 322 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  46.67 
 
 		 322 aa  259  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  46.13 
 
 		 322 aa  259  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  42.72 
 
 		 323 aa  258  8e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  46.33 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0752  trans-hexaprenyltranstransferase  45.81 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130726 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  42.57 
 
 		 323 aa  255  8e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  41.75 
 
 		 323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  43.51 
 
 		 343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  41.42 
 
 		 323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  44.16 
 
 		 321 aa  252  5.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  42.63 
 
 		 323 aa  252  6e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  42.21 
 
 		 330 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  42.86 
 
 		 332 aa  251  9.000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  42.31 
 
 		 323 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  43 
 
 		 345 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  42.86 
 
 		 332 aa  251  1e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  42.31 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0658  polyprenyl synthetase  44.81 
 
 		 341 aa  250  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.586121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  41.75 
 
 		 331 aa  249  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  42.39 
 
 		 337 aa  250  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  42.95 
 
 		 326 aa  248  7e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  47.16 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  43.93 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  44.78 
 
 		 327 aa  246  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  43.04 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  41.16 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  43.37 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  43.04 
 
 		 323 aa  246  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  46.31 
 
 		 322 aa  246  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  43.04 
 
 		 323 aa  246  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  41.16 
 
 		 331 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  41.16 
 
 		 331 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  41.16 
 
 		 331 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  41.88 
 
 		 322 aa  245  8e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  41.53 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  41.23 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  41.75 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  44.37 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  44.3 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  42.72 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  42.72 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  42.72 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  42.72 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  42.72 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  40.33 
 
 		 327 aa  242  5e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  45.67 
 
 		 332 aa  242  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  40.84 
 
 		 331 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  41.75 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  42.72 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  40.92 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  42.07 
 
 		 323 aa  240  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  41.12 
 
 		 320 aa  240  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0894  trans-hexaprenyltranstransferase  40.78 
 
 		 331 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000238398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3220  polyprenyl synthetase  40.78 
 
 		 331 aa  240  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000594957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  41.99 
 
 		 323 aa  239  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  41.04 
 
 		 326 aa  239  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3653  octaprenyl-diphosphate synthase  40.13 
 
 		 323 aa  239  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3126  trans-hexaprenyltranstransferase  40.45 
 
 		 331 aa  239  5e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000273118  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2582  hypothetical protein  41.45 
 
 		 322 aa  239  5.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  41.23 
 
 		 322 aa  238  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  41.42 
 
 		 323 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2709  hypothetical protein  41.45 
 
 		 322 aa  238  8e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  42.72 
 
 		 323 aa  238  8e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  40.78 
 
 		 348 aa  238  8e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  41.42 
 
 		 323 aa  238  9e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  41.42 
 
 		 323 aa  238  9e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  41.42 
 
 		 323 aa  238  9e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  41.42 
 
 		 323 aa  238  9e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  41.42 
 
 		 323 aa  238  9e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  41.42 
 
 		 323 aa  238  9e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  41.42 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  42.21 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0840  trans-hexaprenyltranstransferase  44.52 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.24671  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  40.53 
 
 		 313 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  41.42 
 
 		 323 aa  236  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  42.36 
 
 		 334 aa  236  4e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  42.86 
 
 		 322 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  42.07 
 
 		 325 aa  235  5.0000000000000005e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  45.39 
 
 		 359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  41.99 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  43.64 
 
 		 327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0978  trans-hexaprenyltranstransferase  39.68 
 
 		 331 aa  229  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234439  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2996  octaprenyl-diphosphate synthase  40.58 
 
 		 340 aa  228  9e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  40.84 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  40 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  41.23 
 
 		 322 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3676  trans-hexaprenyltranstransferase  42.9 
 
 		 344 aa  226  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  42.42 
 
 		 345 aa  225  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>