More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0319 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0319  octaprenyl-diphosphate synthase  100 
 
 		 347 aa  673    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00046336  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3242  Polyprenyl synthetase  34.51 
 
 		 354 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.650754  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1537  polyprenyl synthetase family protein  35.52 
 
 		 350 aa  167  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  30.88 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47271  predicted protein  33.63 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00654  Geranylgeranyl diphosphate synthase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874I1]  29.59 
 
 		 396 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.371753 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01592  conserved hypothetical protein  29.92 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  29.35 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  29.82 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  33.21 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  30.28 
 
 		 327 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  31.94 
 
 		 317 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  31.96 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  26.47 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  32.87 
 
 		 332 aa  106  5e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2818  Polyprenyl synthetase  25.6 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  29.64 
 
 		 332 aa  105  8e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  26.67 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  32.41 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  27.3 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  27.3 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  31.84 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46658  geranylgeranyl diphosphate synthase  30.47 
 
 		 347 aa  105  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.606185 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  26.96 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.63 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  29.63 
 
 		 325 aa  104  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3011  Polyprenyl synthetase  33.02 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  30.91 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  26.64 
 
 		 345 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  27.46 
 
 		 332 aa  103  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  29.87 
 
 		 348 aa  102  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00090  farnesyltranstransferase, putative  33.63 
 
 		 322 aa  102  8e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  27.99 
 
 		 323 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  26.96 
 
 		 322 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  30.28 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  31.14 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  31.94 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  29.96 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0188  polyprenyl synthetase  33.04 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84444  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2709  hypothetical protein  27.84 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2582  hypothetical protein  27.84 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  25.14 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  30.24 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  30.68 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  30.7 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  29.57 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  29.52 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  30.77 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  26.89 
 
 		 322 aa  100  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  31.35 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  32.7 
 
 		 322 aa  99.4  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  25.14 
 
 		 322 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  30.18 
 
 		 317 aa  99.4  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0208  trans-hexaprenyltranstransferase  31.2 
 
 		 321 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.647597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  28.03 
 
 		 321 aa  99  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  28.22 
 
 		 320 aa  99.4  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  33.77 
 
 		 324 aa  99.4  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06810  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01210)  31.22 
 
 		 933 aa  98.6  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.977304  normal  0.681153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2210  Polyprenyl synthetase  30.41 
 
 		 348 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal  0.119869 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  25.42 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2658  Polyprenyl synthetase  29.57 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0590185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  32.55 
 
 		 317 aa  98.2  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  27.78 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  24.83 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  32.71 
 
 		 317 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0496  dimethylallyltransferase  27.38 
 
 		 575 aa  98.2  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.432422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  26.15 
 
 		 322 aa  98.6  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  29.6 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  29.09 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  28.38 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  30.77 
 
 		 322 aa  97.8  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0016  Polyprenyl synthetase  26.32 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24479 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.19 
 
 		 322 aa  97.1  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  27.75 
 
 		 331 aa  97.1  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.73 
 
 		 345 aa  96.3  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  25.57 
 
 		 359 aa  96.7  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  30.4 
 
 		 323 aa  96.7  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  27.44 
 
 		 343 aa  96.3  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  29.73 
 
 		 327 aa  96.3  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  29.91 
 
 		 342 aa  95.9  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.03 
 
 		 323 aa  96.3  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  23.84 
 
 		 358 aa  95.9  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  31.7 
 
 		 331 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  27.88 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5924  Trans-hexaprenyltranstransferase  24.49 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  28 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0649  Polyprenyl synthetase  29.49 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.790786  normal  0.0239993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  30.88 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  31.7 
 
 		 331 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  31.7 
 
 		 331 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  26.91 
 
 		 326 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3189  trans-hexaprenyltranstransferase  27.27 
 
 		 322 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  30.63 
 
 		 332 aa  94  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0657  polyprenyl synthetase  28.77 
 
 		 333 aa  94  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  31.25 
 
 		 322 aa  94  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0742  trans-hexaprenyltranstransferase  28.77 
 
 		 333 aa  94  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.247757  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  27.78 
 
 		 335 aa  94  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  32.89 
 
 		 323 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  32.89 
 
 		 323 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  28.23 
 
 		 320 aa  93.6  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>