More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_21620 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_21620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  100 
 
 		 335 aa  656    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751296  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07520  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  57.27 
 
 		 337 aa  352  7e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2825  Polyprenyl synthetase  52.94 
 
 		 366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0348923 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0483  Polyprenyl synthetase  55.56 
 
 		 343 aa  318  6e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  54.03 
 
 		 336 aa  316  4e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2702  Trans-hexaprenyltranstransferase  54.05 
 
 		 335 aa  312  5.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0649  Polyprenyl synthetase  56.19 
 
 		 344 aa  311  6.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.790786  normal  0.0239993 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  54.74 
 
 		 334 aa  311  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3130  trans-hexaprenyltranstransferase  50 
 
 		 367 aa  308  6.999999999999999e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0534  trans-hexaprenyltranstransferase  50.61 
 
 		 334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4051  polyprenyl synthetase  49.09 
 
 		 356 aa  280  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  50.93 
 
 		 349 aa  279  5e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  49.7 
 
 		 354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  48.18 
 
 		 338 aa  272  6e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0598  Trans-hexaprenyltranstransferase  48.62 
 
 		 331 aa  272  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0295  trans-hexaprenyltranstransferase  47.71 
 
 		 331 aa  269  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4544  Trans-hexaprenyltranstransferase  48.91 
 
 		 352 aa  265  8e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4449  polyprenyl synthetase  47.42 
 
 		 344 aa  263  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0447682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7677  Polyprenyl synthetase  45.99 
 
 		 351 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4404  Trans-hexaprenyltranstransferase  48.8 
 
 		 331 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5946  Trans-hexaprenyltranstransferase  45.06 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0552  polyprenyl synthetase  47.38 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0863635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  47.11 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  44.92 
 
 		 333 aa  256  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  44.91 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  44.67 
 
 		 338 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5067  Trans-hexaprenyltranstransferase  44.61 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0988  Polyprenyl synthetase  45.48 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21410  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  43.65 
 
 		 324 aa  223  4.9999999999999996e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.242583  hitchhiker  0.0000164953 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0785  trans-hexaprenyltranstransferase  41.57 
 
 		 342 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856198  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0766  trans-hexaprenyltranstransferase  43.37 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0771  trans-hexaprenyltranstransferase  41.57 
 
 		 335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0992  trans-hexaprenyltranstransferase  41.21 
 
 		 329 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5253  trans-hexaprenyltranstransferase  40.36 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0733  Trans-hexaprenyltranstransferase  40.43 
 
 		 326 aa  198  9e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10572  polyprenyl-diphosphate synthase grcC1  43.75 
 
 		 335 aa  195  7e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.441257 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.48 
 
 		 320 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.48 
 
 		 320 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.48 
 
 		 320 aa  176  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  31.17 
 
 		 320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.21 
 
 		 320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.87 
 
 		 320 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.96 
 
 		 320 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.11 
 
 		 320 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.65 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.65 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.65 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.65 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.65 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.33 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  33.63 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  35.12 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  34.45 
 
 		 336 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  32.15 
 
 		 343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  36.15 
 
 		 336 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  31.66 
 
 		 323 aa  162  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  30.25 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  34.46 
 
 		 336 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  31.55 
 
 		 319 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  37.77 
 
 		 322 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  37.12 
 
 		 322 aa  160  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  31.55 
 
 		 319 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.44 
 
 		 320 aa  159  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  35.26 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11007  polyprenyl-diphosphate synthase grcC2  35.87 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000025551  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  32.09 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  30.75 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.23 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  34.97 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  34.26 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  30.7 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  34.26 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  32.13 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1905  Polyprenyl synthetase  39.93 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  34.74 
 
 		 322 aa  155  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  32.39 
 
 		 322 aa  156  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  30.35 
 
 		 324 aa  155  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  33.92 
 
 		 340 aa  155  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  33.64 
 
 		 335 aa  155  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  33.56 
 
 		 328 aa  155  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  34.24 
 
 		 322 aa  155  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  29.85 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  32.56 
 
 		 345 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  35.13 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2084  Polyprenyl synthetase  29.79 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.235717  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  32.66 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  32.43 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  30.25 
 
 		 323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  31.86 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  30.57 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  33.01 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  32.37 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  31.55 
 
 		 322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  35.23 
 
 		 341 aa  152  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  32.42 
 
 		 322 aa  152  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>