More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0988 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0988  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 326 aa  644    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  58.77 
 
 		 333 aa  360  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  59.38 
 
 		 337 aa  358  7e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  59.04 
 
 		 338 aa  356  2.9999999999999997e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0785  trans-hexaprenyltranstransferase  58.1 
 
 		 342 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856198  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0771  trans-hexaprenyltranstransferase  58.1 
 
 		 335 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0992  trans-hexaprenyltranstransferase  56.57 
 
 		 329 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0766  trans-hexaprenyltranstransferase  58.2 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4544  Trans-hexaprenyltranstransferase  58.15 
 
 		 352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5253  trans-hexaprenyltranstransferase  53.52 
 
 		 335 aa  325  5e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0598  Trans-hexaprenyltranstransferase  53.4 
 
 		 331 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  55.08 
 
 		 338 aa  307  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0534  trans-hexaprenyltranstransferase  54.15 
 
 		 334 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10572  polyprenyl-diphosphate synthase grcC1  55.35 
 
 		 335 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.441257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4051  polyprenyl synthetase  56.52 
 
 		 356 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  54.1 
 
 		 349 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0295  trans-hexaprenyltranstransferase  52.74 
 
 		 331 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0552  polyprenyl synthetase  53.92 
 
 		 338 aa  302  6.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0863635 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4449  polyprenyl synthetase  55.9 
 
 		 344 aa  294  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0447682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7677  Polyprenyl synthetase  51.85 
 
 		 351 aa  288  9e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5067  Trans-hexaprenyltranstransferase  52.5 
 
 		 334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5946  Trans-hexaprenyltranstransferase  51.7 
 
 		 322 aa  285  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4404  Trans-hexaprenyltranstransferase  52.96 
 
 		 331 aa  281  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0733  Trans-hexaprenyltranstransferase  49.39 
 
 		 326 aa  278  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  50.78 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07520  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  48.05 
 
 		 337 aa  265  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21410  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 		 324 aa  252  6e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.242583  hitchhiker  0.0000164953 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11007  polyprenyl-diphosphate synthase grcC2  45.51 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000025551  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  45.48 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751296  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2825  Polyprenyl synthetase  48.62 
 
 		 366 aa  247  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0348923 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0649  Polyprenyl synthetase  46.83 
 
 		 344 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.790786  normal  0.0239993 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0483  Polyprenyl synthetase  46.47 
 
 		 343 aa  240  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2702  Trans-hexaprenyltranstransferase  47.56 
 
 		 335 aa  239  5e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3130  trans-hexaprenyltranstransferase  47.24 
 
 		 367 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  46.48 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  44.95 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  45.92 
 
 		 334 aa  225  8e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.75 
 
 		 323 aa  185  8e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.41 
 
 		 320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  36.36 
 
 		 318 aa  180  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  32.21 
 
 		 322 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  35.44 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  33.87 
 
 		 322 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  32.8 
 
 		 320 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  32.39 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  35.22 
 
 		 322 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.01 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.22 
 
 		 320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  37.02 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.95 
 
 		 323 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  34.97 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0858  solanesyl diphosphate synthase  35.71 
 
 		 323 aa  168  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0128707  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.6 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  36.05 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  35.03 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  35.42 
 
 		 333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.01 
 
 		 321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  32.12 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.57 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  35.51 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  33.86 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.83 
 
 		 320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  34.8 
 
 		 333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  34.8 
 
 		 333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06741  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  32.65 
 
 		 323 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.5 
 
 		 323 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  30.97 
 
 		 348 aa  162  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  31.12 
 
 		 323 aa  162  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.5 
 
 		 320 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.5 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.5 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.5 
 
 		 320 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06441  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  32.65 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.5 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.5 
 
 		 320 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.5 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  33.23 
 
 		 340 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0742  trans-hexaprenyltranstransferase  33.23 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.247757  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0149  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.28 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0657  polyprenyl synthetase  33.23 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  32.01 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  34.64 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  32.42 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.18 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  32.48 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  32.48 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  35.62 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2582  hypothetical protein  31.25 
 
 		 322 aa  159  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  31.71 
 
 		 331 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  31.71 
 
 		 331 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  31.71 
 
 		 331 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1227  solanesyl diphosphate synthase  35.05 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  31.71 
 
 		 331 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  35.09 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  34.26 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0374  solanesyl diphosphate synthase  35.64 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0383  solanesyl diphosphate synthase  35.64 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1137  trans-hexaprenyltranstransferase  34.47 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11534  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2709  hypothetical protein  31.33 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  30.7 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>