More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3361 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 322 aa  659    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  56.97 
 
 		 323 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  52.68 
 
 		 320 aa  352  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  49.07 
 
 		 322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  50.16 
 
 		 318 aa  319  3e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  46.27 
 
 		 320 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  46.27 
 
 		 322 aa  289  5.0000000000000004e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  46.39 
 
 		 320 aa  285  5.999999999999999e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  44.1 
 
 		 320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  43.79 
 
 		 323 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  43.79 
 
 		 323 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  43.79 
 
 		 320 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  43.79 
 
 		 320 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  44.41 
 
 		 320 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  43.48 
 
 		 323 aa  281  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  43.79 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  43.79 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  43.79 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  43.79 
 
 		 320 aa  279  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  43.79 
 
 		 320 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  45.48 
 
 		 321 aa  258  8e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  38.61 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  36.1 
 
 		 322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  37.3 
 
 		 323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  38.31 
 
 		 319 aa  220  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  38.31 
 
 		 319 aa  220  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  36.94 
 
 		 344 aa  216  4e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  35.35 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  40.07 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  34.71 
 
 		 322 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.5 
 
 		 322 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  34.5 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  35.74 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  37.74 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0564  trans-hexaprenyltranstransferase  39.09 
 
 		 318 aa  206  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  35.33 
 
 		 338 aa  206  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  33.44 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  38.04 
 
 		 322 aa  206  6e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  34.59 
 
 		 336 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  36.65 
 
 		 360 aa  205  8e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  37.46 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  38.91 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  38.91 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  35.2 
 
 		 358 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  35.14 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  37.03 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  33.96 
 
 		 340 aa  203  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  38.38 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  34.28 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  34.29 
 
 		 341 aa  203  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  39.06 
 
 		 333 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  33.65 
 
 		 340 aa  202  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  34.28 
 
 		 336 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  35.02 
 
 		 356 aa  201  9e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  32.8 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  34.07 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  38.44 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  34.38 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  36.31 
 
 		 333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  34.28 
 
 		 351 aa  200  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  34.59 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  32.49 
 
 		 338 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  33.65 
 
 		 336 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.69 
 
 		 337 aa  198  7.999999999999999e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1698  polyprenyl synthetase  36.33 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  33.65 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0722  polyprenyl synthetase  35.67 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  35.96 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.47 
 
 		 338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  33.02 
 
 		 336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  33.54 
 
 		 337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  32.8 
 
 		 336 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  35.48 
 
 		 323 aa  196  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  34.38 
 
 		 340 aa  195  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0968  polyprenyl synthetase  37.63 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10311  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  35 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  36.88 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  33.75 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0458  polyprenyl synthetase  34.07 
 
 		 338 aa  193  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.480075 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  35.22 
 
 		 349 aa  193  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4378  Polyprenyl synthetase  33.23 
 
 		 345 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  35.03 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  35.02 
 
 		 331 aa  192  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  33.75 
 
 		 322 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.81 
 
 		 325 aa  192  6e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  37.74 
 
 		 332 aa  192  7e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  36.22 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2749  polyprenyl synthetase  33.23 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0535555  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0598  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.65 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  34.18 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  36.25 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  41.15 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  33.23 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  35.24 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  33.65 
 
 		 323 aa  189  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_002936  DET0389  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.42 
 
 		 324 aa  190  4e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0293538  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  33.44 
 
 		 323 aa  189  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  32.26 
 
 		 327 aa  189  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5253  trans-hexaprenyltranstransferase  35.78 
 
 		 335 aa  189  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>