More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_17720 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_17720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  100 
 
 		 354 aa  691    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2825  Polyprenyl synthetase  53.3 
 
 		 366 aa  325  8.000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0348923 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3130  trans-hexaprenyltranstransferase  52.3 
 
 		 367 aa  323  4e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07520  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  51.27 
 
 		 337 aa  292  5e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  52.16 
 
 		 336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0483  Polyprenyl synthetase  52.48 
 
 		 343 aa  282  5.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  52.73 
 
 		 334 aa  281  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0649  Polyprenyl synthetase  53.7 
 
 		 344 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.790786  normal  0.0239993 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  47.99 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  49.08 
 
 		 349 aa  275  8e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  49.7 
 
 		 335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751296  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7677  Polyprenyl synthetase  46.11 
 
 		 351 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4449  polyprenyl synthetase  48.02 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0447682 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5067  Trans-hexaprenyltranstransferase  46.96 
 
 		 334 aa  265  7e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4051  polyprenyl synthetase  47.37 
 
 		 356 aa  265  8.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4544  Trans-hexaprenyltranstransferase  49.38 
 
 		 352 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2702  Trans-hexaprenyltranstransferase  51.52 
 
 		 335 aa  263  4e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0295  trans-hexaprenyltranstransferase  47.31 
 
 		 331 aa  262  6e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  46.81 
 
 		 338 aa  257  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0534  trans-hexaprenyltranstransferase  47.21 
 
 		 334 aa  256  5e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4404  Trans-hexaprenyltranstransferase  49.06 
 
 		 331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0598  Trans-hexaprenyltranstransferase  46.08 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0552  polyprenyl synthetase  44.01 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0863635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5946  Trans-hexaprenyltranstransferase  45.68 
 
 		 322 aa  246  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21410  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  43.5 
 
 		 324 aa  242  7e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.242583  hitchhiker  0.0000164953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0766  trans-hexaprenyltranstransferase  46.93 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0785  trans-hexaprenyltranstransferase  46.93 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856198  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0771  trans-hexaprenyltranstransferase  46.93 
 
 		 335 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  45.02 
 
 		 338 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  43.47 
 
 		 333 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5253  trans-hexaprenyltranstransferase  46.25 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  42.6 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0733  Trans-hexaprenyltranstransferase  45.03 
 
 		 326 aa  225  7e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10572  polyprenyl-diphosphate synthase grcC1  46.25 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.441257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0992  trans-hexaprenyltranstransferase  44.69 
 
 		 329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0988  Polyprenyl synthetase  44.21 
 
 		 326 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  37 
 
 		 336 aa  176  7e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11007  polyprenyl-diphosphate synthase grcC2  39.13 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000025551  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4378  Polyprenyl synthetase  34.28 
 
 		 345 aa  170  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  33.72 
 
 		 340 aa  169  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  32.74 
 
 		 326 aa  169  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  33.72 
 
 		 340 aa  169  8e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  32.85 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  33.43 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2749  polyprenyl synthetase  33.99 
 
 		 345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0535555  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  33.23 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.53 
 
 		 320 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  34.43 
 
 		 336 aa  166  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  37.33 
 
 		 331 aa  167  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  33.72 
 
 		 336 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  35.48 
 
 		 351 aa  166  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  37.21 
 
 		 344 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  33.14 
 
 		 336 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  36.27 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  36.27 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  37.09 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  35.38 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  35.53 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  31.78 
 
 		 320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  33.24 
 
 		 336 aa  162  7e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  33.54 
 
 		 336 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  32.82 
 
 		 322 aa  162  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  34.69 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  30.96 
 
 		 324 aa  159  5e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  31.18 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  38.13 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  34.27 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  33.64 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  38.08 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  33.04 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  33.75 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  33.13 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  32.82 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.11 
 
 		 322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  36.51 
 
 		 322 aa  155  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  35.62 
 
 		 331 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  35.62 
 
 		 331 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  35.62 
 
 		 331 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  35.62 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.82 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  34.64 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  34.71 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  34.26 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  30.4 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  33.88 
 
 		 332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  34.23 
 
 		 320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  35.2 
 
 		 322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  33.77 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  34.32 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  32.1 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  32.21 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  33.88 
 
 		 332 aa  153  4e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  36.71 
 
 		 332 aa  153  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  34.43 
 
 		 337 aa  153  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  35.31 
 
 		 323 aa  153  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  29.52 
 
 		 317 aa  153  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.89 
 
 		 320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  32.41 
 
 		 328 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  28.31 
 
 		 324 aa  152  8e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  29.85 
 
 		 324 aa  152  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>