More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4544 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4544  Trans-hexaprenyltranstransferase  100 
 
 		 352 aa  689    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  62.73 
 
 		 349 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0598  Trans-hexaprenyltranstransferase  61.22 
 
 		 331 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4449  polyprenyl synthetase  64.61 
 
 		 344 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0447682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0534  trans-hexaprenyltranstransferase  61.08 
 
 		 334 aa  358  5e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7677  Polyprenyl synthetase  60.31 
 
 		 351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4051  polyprenyl synthetase  63.96 
 
 		 356 aa  355  6.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0295  trans-hexaprenyltranstransferase  58.79 
 
 		 331 aa  353  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  58.84 
 
 		 333 aa  342  4e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4404  Trans-hexaprenyltranstransferase  61.36 
 
 		 331 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5946  Trans-hexaprenyltranstransferase  60.46 
 
 		 322 aa  341  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  58.2 
 
 		 338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  57.45 
 
 		 334 aa  335  7e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0552  polyprenyl synthetase  58.07 
 
 		 338 aa  332  5e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0863635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  56.27 
 
 		 337 aa  330  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  55.38 
 
 		 338 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5067  Trans-hexaprenyltranstransferase  57.61 
 
 		 334 aa  323  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0988  Polyprenyl synthetase  58.15 
 
 		 326 aa  316  5e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07520  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  52.69 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0785  trans-hexaprenyltranstransferase  51.8 
 
 		 342 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856198  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0771  trans-hexaprenyltranstransferase  51.96 
 
 		 335 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0766  trans-hexaprenyltranstransferase  54.19 
 
 		 325 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5253  trans-hexaprenyltranstransferase  55.02 
 
 		 335 aa  298  8e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0992  trans-hexaprenyltranstransferase  55.02 
 
 		 329 aa  298  9e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2702  Trans-hexaprenyltranstransferase  55.28 
 
 		 335 aa  296  4e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2825  Polyprenyl synthetase  50.29 
 
 		 366 aa  292  5e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0348923 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  51.34 
 
 		 336 aa  292  6e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  51.99 
 
 		 334 aa  289  4e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0649  Polyprenyl synthetase  51.17 
 
 		 344 aa  289  6e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.790786  normal  0.0239993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3130  trans-hexaprenyltranstransferase  49.85 
 
 		 367 aa  286  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0483  Polyprenyl synthetase  48.7 
 
 		 343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21410  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  50.16 
 
 		 324 aa  284  2.0000000000000002e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.242583  hitchhiker  0.0000164953 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  48.33 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751296  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  49.38 
 
 		 354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0733  Trans-hexaprenyltranstransferase  51.59 
 
 		 326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10572  polyprenyl-diphosphate synthase grcC1  51.64 
 
 		 335 aa  269  7e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.441257 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11007  polyprenyl-diphosphate synthase grcC2  42.86 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000025551  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  36.45 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.14 
 
 		 323 aa  192  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.14 
 
 		 323 aa  192  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.14 
 
 		 320 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.14 
 
 		 320 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.14 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.82 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.49 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  32.49 
 
 		 320 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  37.18 
 
 		 320 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.26 
 
 		 320 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.58 
 
 		 320 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  38.27 
 
 		 333 aa  189  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.39 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.39 
 
 		 320 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  36.93 
 
 		 318 aa  186  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.08 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.39 
 
 		 320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  35.05 
 
 		 322 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  35.5 
 
 		 323 aa  182  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  35.18 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  34.48 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  33.11 
 
 		 322 aa  179  9e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.25 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  35.14 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  32.5 
 
 		 324 aa  177  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  36.25 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  36 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  35.78 
 
 		 335 aa  176  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  36.42 
 
 		 333 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  36.17 
 
 		 330 aa  175  9e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  35.31 
 
 		 313 aa  175  9e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  34.57 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  35.74 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  33.64 
 
 		 326 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  35.11 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  33.88 
 
 		 324 aa  172  7.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  34.39 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  35.8 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  34.52 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  35.8 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06741  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  32.57 
 
 		 323 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3006  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.43 
 
 		 324 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06441  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  32.57 
 
 		 323 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10311  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  33.77 
 
 		 323 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  33.55 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  34.5 
 
 		 322 aa  169  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  35.13 
 
 		 323 aa  168  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  32.15 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.08 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  34.85 
 
 		 344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1227  solanesyl diphosphate synthase  34.63 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  34.38 
 
 		 322 aa  167  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1905  Polyprenyl synthetase  43.37 
 
 		 338 aa  167  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  33.76 
 
 		 322 aa  167  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  36.39 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  34.49 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  34.77 
 
 		 351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  34.41 
 
 		 360 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  33.55 
 
 		 337 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06831  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  31.94 
 
 		 323 aa  165  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  31.95 
 
 		 328 aa  165  9e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>