More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1905 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1905  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 338 aa  651    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  47.66 
 
 		 334 aa  189  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  48.51 
 
 		 338 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  42.8 
 
 		 333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4051  polyprenyl synthetase  45.93 
 
 		 356 aa  178  9e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0552  polyprenyl synthetase  45.11 
 
 		 338 aa  176  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0863635 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  44.92 
 
 		 349 aa  176  6e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0649  Polyprenyl synthetase  45.26 
 
 		 344 aa  172  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.790786  normal  0.0239993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  42.12 
 
 		 337 aa  172  9e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5067  Trans-hexaprenyltranstransferase  43.59 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21410  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  44.64 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.242583  hitchhiker  0.0000164953 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  38.05 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0295  trans-hexaprenyltranstransferase  44.02 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0534  trans-hexaprenyltranstransferase  45.37 
 
 		 334 aa  170  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.14 
 
 		 320 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4449  polyprenyl synthetase  46.38 
 
 		 344 aa  169  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0447682 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  40.3 
 
 		 335 aa  169  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.81 
 
 		 320 aa  169  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.81 
 
 		 320 aa  169  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0598  Trans-hexaprenyltranstransferase  43.37 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7677  Polyprenyl synthetase  43.29 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4544  Trans-hexaprenyltranstransferase  43.11 
 
 		 352 aa  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  43.1 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.81 
 
 		 320 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.43 
 
 		 320 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.52 
 
 		 320 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4404  Trans-hexaprenyltranstransferase  41.11 
 
 		 331 aa  165  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  41.53 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  38.52 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0733  Trans-hexaprenyltranstransferase  39.42 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.18 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5946  Trans-hexaprenyltranstransferase  40.16 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07520  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  43.83 
 
 		 337 aa  164  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.75 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.75 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.75 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5253  trans-hexaprenyltranstransferase  42.25 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.75 
 
 		 320 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0766  trans-hexaprenyltranstransferase  43.08 
 
 		 325 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0771  trans-hexaprenyltranstransferase  43.08 
 
 		 335 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.75 
 
 		 320 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0785  trans-hexaprenyltranstransferase  43.08 
 
 		 342 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856198  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.75 
 
 		 320 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0988  Polyprenyl synthetase  44.54 
 
 		 326 aa  162  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2825  Polyprenyl synthetase  42.57 
 
 		 366 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0348923 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  40.78 
 
 		 344 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3130  trans-hexaprenyltranstransferase  43.62 
 
 		 367 aa  160  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  41.96 
 
 		 358 aa  159  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  43.28 
 
 		 354 aa  159  7e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  34.56 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10572  polyprenyl-diphosphate synthase grcC1  40.07 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.441257 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0483  Polyprenyl synthetase  41.48 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  37.45 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0992  trans-hexaprenyltranstransferase  41.57 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  36 
 
 		 322 aa  153  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  37.19 
 
 		 333 aa  152  7e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  31.37 
 
 		 319 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  31.37 
 
 		 319 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  38.55 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  38.46 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  40.43 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  37.83 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  38.72 
 
 		 322 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  30.63 
 
 		 319 aa  149  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  36.01 
 
 		 333 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  36.01 
 
 		 333 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.11 
 
 		 326 aa  149  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2899  octaprenyl-diphosphate synthase  39.33 
 
 		 322 aa  149  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2517  Polyprenyl synthetase  39.33 
 
 		 322 aa  149  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2702  Trans-hexaprenyltranstransferase  43.67 
 
 		 335 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  36.11 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  35.14 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  38.46 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1320  trans-hexaprenyltranstransferase  38.7 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195026  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  37.62 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  34.85 
 
 		 326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  39.23 
 
 		 339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1137  trans-hexaprenyltranstransferase  38.08 
 
 		 323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  35.11 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  35.11 
 
 		 323 aa  145  8.000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  37.26 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.34 
 
 		 322 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0374  solanesyl diphosphate synthase  37.23 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  35.85 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0383  solanesyl diphosphate synthase  37.23 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  35.31 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.73 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  39.47 
 
 		 332 aa  143  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2996  octaprenyl-diphosphate synthase  39.65 
 
 		 340 aa  143  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  40.18 
 
 		 340 aa  143  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  38.39 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  40.18 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  37.72 
 
 		 323 aa  143  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  39.91 
 
 		 325 aa  143  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  36.82 
 
 		 322 aa  142  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  40 
 
 		 322 aa  142  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  35.38 
 
 		 322 aa  142  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  40.18 
 
 		 356 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  40.37 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  37.79 
 
 		 331 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>