More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0992 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0992  trans-hexaprenyltranstransferase  100 
 
 
329 aa  657    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5253  trans-hexaprenyltranstransferase  89.67 
 
 
335 aa  568  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0771  trans-hexaprenyltranstransferase  87.23 
 
 
335 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0785  trans-hexaprenyltranstransferase  87.23 
 
 
342 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856198  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0766  trans-hexaprenyltranstransferase  87.08 
 
 
325 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10572  polyprenyl-diphosphate synthase grcC1  72.04 
 
 
335 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.441257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  60.66 
 
 
338 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11007  polyprenyl-diphosphate synthase grcC2  58.28 
 
 
325 aa  358  6e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000025551  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  55.86 
 
 
337 aa  332  5e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  54.01 
 
 
333 aa  331  9e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0733  Trans-hexaprenyltranstransferase  55.79 
 
 
326 aa  323  3e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0988  Polyprenyl synthetase  56.57 
 
 
326 aa  321  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0598  Trans-hexaprenyltranstransferase  51.22 
 
 
331 aa  316  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  52.48 
 
 
349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4544  Trans-hexaprenyltranstransferase  55.02 
 
 
352 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4051  polyprenyl synthetase  53.66 
 
 
356 aa  299  5e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4449  polyprenyl synthetase  54.84 
 
 
344 aa  298  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0447682 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0552  polyprenyl synthetase  50 
 
 
338 aa  296  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0863635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4404  Trans-hexaprenyltranstransferase  51.2 
 
 
331 aa  295  6e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0534  trans-hexaprenyltranstransferase  53.07 
 
 
334 aa  294  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  49.85 
 
 
334 aa  292  4e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0295  trans-hexaprenyltranstransferase  49.53 
 
 
331 aa  291  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7677  Polyprenyl synthetase  50.32 
 
 
351 aa  285  9e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21410  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  49.68 
 
 
324 aa  279  5e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.242583  hitchhiker  0.0000164953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  48.15 
 
 
338 aa  279  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5946  Trans-hexaprenyltranstransferase  49.69 
 
 
322 aa  277  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112624  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5067  Trans-hexaprenyltranstransferase  47.04 
 
 
334 aa  275  7e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  47.71 
 
 
334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2702  Trans-hexaprenyltranstransferase  48 
 
 
335 aa  248  8e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07520  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  45.02 
 
 
337 aa  246  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  46.93 
 
 
336 aa  245  9e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0649  Polyprenyl synthetase  44.14 
 
 
344 aa  239  4e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.790786  normal  0.0239993 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0483  Polyprenyl synthetase  44.68 
 
 
343 aa  236  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  44.69 
 
 
354 aa  232  5e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2825  Polyprenyl synthetase  43.65 
 
 
366 aa  230  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0348923 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3130  trans-hexaprenyltranstransferase  43.34 
 
 
367 aa  223  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  41.21 
 
 
335 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751296  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  36.83 
 
 
322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.42 
 
 
323 aa  195  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  35.03 
 
 
320 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  37.2 
 
 
322 aa  186  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  37.92 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  37.74 
 
 
318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.28 
 
 
320 aa  182  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  35.86 
 
 
323 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.4 
 
 
320 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1227  solanesyl diphosphate synthase  36.13 
 
 
323 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0858  solanesyl diphosphate synthase  34.63 
 
 
323 aa  176  6e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0128707  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  30.67 
 
 
319 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  35 
 
 
323 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.67 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  33.01 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  32.09 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  34.39 
 
 
322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.48 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.54 
 
 
320 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.12 
 
 
320 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.02 
 
 
320 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  37.07 
 
 
344 aa  170  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  33.97 
 
 
332 aa  169  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.8 
 
 
323 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.8 
 
 
323 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.8 
 
 
323 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.8 
 
 
320 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.8 
 
 
320 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  30.4 
 
 
331 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  30.65 
 
 
319 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  30.65 
 
 
319 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0374  solanesyl diphosphate synthase  34.75 
 
 
323 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1137  trans-hexaprenyltranstransferase  33.99 
 
 
323 aa  167  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11534  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0383  solanesyl diphosphate synthase  34.75 
 
 
323 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.8 
 
 
320 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  35.74 
 
 
336 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10311  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  33 
 
 
323 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  35.81 
 
 
323 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0149  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.48 
 
 
338 aa  166  6.9999999999999995e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6988  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.91 
 
 
321 aa  165  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.955894  hitchhiker  0.000428726 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  34.24 
 
 
322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  33.44 
 
 
332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.49 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  33.55 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  33.54 
 
 
332 aa  163  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.49 
 
 
320 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  35.71 
 
 
333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  34.82 
 
 
333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  31.95 
 
 
323 aa  162  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06441  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  30.96 
 
 
323 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06741  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  30.96 
 
 
323 aa  162  7e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.45 
 
 
322 aa  162  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2996  octaprenyl-diphosphate synthase  33.66 
 
 
340 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  33.56 
 
 
322 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  31.95 
 
 
323 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  33.86 
 
 
322 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1320  trans-hexaprenyltranstransferase  32.46 
 
 
323 aa  159  5e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195026  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  31.75 
 
 
322 aa  159  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  34.54 
 
 
326 aa  159  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  34.5 
 
 
333 aa  159  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  35.02 
 
 
323 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  39.6 
 
 
334 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  33.02 
 
 
351 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.470384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>