More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1320 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1320  trans-hexaprenyltranstransferase  100 
 
 
323 aa  652    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195026  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1137  trans-hexaprenyltranstransferase  87.31 
 
 
323 aa  577  1e-164  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11534  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10311  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  80.5 
 
 
323 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18951  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  82.66 
 
 
323 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  78.02 
 
 
323 aa  505  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  78.02 
 
 
323 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0618  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  72.76 
 
 
323 aa  494  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06741  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  73.07 
 
 
323 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06831  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  73.29 
 
 
323 aa  491  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06441  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  73.07 
 
 
323 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0858  solanesyl diphosphate synthase  65.33 
 
 
323 aa  422  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0128707  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  65.22 
 
 
323 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  63.16 
 
 
323 aa  413  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  61.49 
 
 
323 aa  414  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1227  solanesyl diphosphate synthase  62.54 
 
 
323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0383  solanesyl diphosphate synthase  63.47 
 
 
323 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0374  solanesyl diphosphate synthase  63.47 
 
 
323 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  60.37 
 
 
323 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51700  chloroplast Clp protease, subunit of ClpP peptidase complex  51.92 
 
 
311 aa  317  2e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.653243  hitchhiker  0.00209917 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16615  predicted protein  44.97 
 
 
325 aa  251  1e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.366634  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10340  hexaprenyl pyrophosphate synthetase Coq1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06120)  37.7 
 
 
456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31245  predicted protein  41.82 
 
 
332 aa  232  7.000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00231541  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01740  trans-hexaprenyltranstransferase, putative  44.24 
 
 
483 aa  212  7e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.420752  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15180  predicted protein  40 
 
 
309 aa  210  3e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.525006  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86778  hexaprenyl pyrophosphate synthetase, mitochondrial precursor (HPS)  39.8 
 
 
465 aa  208  9e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.337551  normal  0.144508 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  36.27 
 
 
322 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  34.69 
 
 
322 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  34.17 
 
 
322 aa  189  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  33.44 
 
 
319 aa  188  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  33.44 
 
 
319 aa  188  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  35.25 
 
 
322 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  34.01 
 
 
322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  34.45 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.02 
 
 
320 aa  183  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.38 
 
 
320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1698  polyprenyl synthetase  38.91 
 
 
349 aa  182  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  34.68 
 
 
322 aa  182  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  32.99 
 
 
319 aa  182  8.000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.7 
 
 
320 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.68 
 
 
322 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  35.19 
 
 
327 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.7 
 
 
323 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.7 
 
 
323 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.13 
 
 
323 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.7 
 
 
320 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  38.14 
 
 
344 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  33.86 
 
 
322 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  37.28 
 
 
323 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.7 
 
 
320 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  37.28 
 
 
323 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.7 
 
 
320 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.7 
 
 
320 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  35.54 
 
 
323 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  37.16 
 
 
322 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  36.11 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  36.11 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  36.11 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.38 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  36.24 
 
 
331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  36.11 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  36.11 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  36.24 
 
 
331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  36.11 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  36.24 
 
 
331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  36.11 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  36.11 
 
 
323 aa  179  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2323  polyprenyl synthetase  37.2 
 
 
349 aa  179  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0658  polyprenyl synthetase  33.75 
 
 
341 aa  179  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.586121  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.28 
 
 
320 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  34.92 
 
 
343 aa  179  8e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  35.76 
 
 
370 aa  178  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  35.76 
 
 
370 aa  178  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  35.76 
 
 
370 aa  178  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  35.76 
 
 
323 aa  178  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  35.76 
 
 
370 aa  178  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  35.76 
 
 
370 aa  178  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  36.82 
 
 
322 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.37 
 
 
322 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_332  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.21 
 
 
324 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  33.12 
 
 
322 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  36.82 
 
 
322 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.75 
 
 
320 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  38.26 
 
 
322 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.46 
 
 
337 aa  177  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.31 
 
 
320 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  35.89 
 
 
331 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  36.49 
 
 
322 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  31.41 
 
 
320 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  36.49 
 
 
322 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_002936  DET0389  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.21 
 
 
324 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0293538  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  36.11 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  38.11 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  36.24 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  35.42 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  32.72 
 
 
334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  36.11 
 
 
323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  35.19 
 
 
323 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  35.14 
 
 
330 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3342  Polyprenyl synthetase  38.19 
 
 
331 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000667178  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  34.16 
 
 
325 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>