More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0281 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  100 
 
 		 349 aa  691    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4404  Trans-hexaprenyltranstransferase  67.29 
 
 		 331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0598  Trans-hexaprenyltranstransferase  65.59 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0295  trans-hexaprenyltranstransferase  62.9 
 
 		 331 aa  384  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4051  polyprenyl synthetase  62.39 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7677  Polyprenyl synthetase  58.95 
 
 		 351 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0552  polyprenyl synthetase  62.27 
 
 		 338 aa  371  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0863635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4544  Trans-hexaprenyltranstransferase  62.73 
 
 		 352 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  61.54 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0534  trans-hexaprenyltranstransferase  59.64 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4449  polyprenyl synthetase  62.84 
 
 		 344 aa  364  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0447682 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5067  Trans-hexaprenyltranstransferase  60.44 
 
 		 334 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  60.12 
 
 		 334 aa  352  4e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  55.52 
 
 		 333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5946  Trans-hexaprenyltranstransferase  55.86 
 
 		 322 aa  319  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  55.76 
 
 		 338 aa  318  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  54.71 
 
 		 337 aa  315  6e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07520  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  52.54 
 
 		 337 aa  314  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2825  Polyprenyl synthetase  52.12 
 
 		 366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0348923 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21410  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  52.96 
 
 		 324 aa  305  8.000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.242583  hitchhiker  0.0000164953 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0649  Polyprenyl synthetase  52.45 
 
 		 344 aa  305  8.000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.790786  normal  0.0239993 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0785  trans-hexaprenyltranstransferase  52.21 
 
 		 342 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856198  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0766  trans-hexaprenyltranstransferase  53.68 
 
 		 325 aa  301  9e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0771  trans-hexaprenyltranstransferase  54.04 
 
 		 335 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  54.46 
 
 		 334 aa  296  5e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5253  trans-hexaprenyltranstransferase  51.35 
 
 		 335 aa  294  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3130  trans-hexaprenyltranstransferase  51.2 
 
 		 367 aa  287  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0992  trans-hexaprenyltranstransferase  52.48 
 
 		 329 aa  285  7e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0988  Polyprenyl synthetase  54.1 
 
 		 326 aa  281  9e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0483  Polyprenyl synthetase  50.3 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10572  polyprenyl-diphosphate synthase grcC1  53.87 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.441257 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  50.93 
 
 		 335 aa  279  5e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751296  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2702  Trans-hexaprenyltranstransferase  52.54 
 
 		 335 aa  277  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  49.08 
 
 		 354 aa  275  8e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  49.4 
 
 		 336 aa  273  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0733  Trans-hexaprenyltranstransferase  50.32 
 
 		 326 aa  267  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11007  polyprenyl-diphosphate synthase grcC2  41.38 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000025551  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  38.54 
 
 		 318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  33.65 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.49 
 
 		 323 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  36.92 
 
 		 333 aa  189  7e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.86 
 
 		 320 aa  189  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  36.92 
 
 		 333 aa  189  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  37.7 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  37.62 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  36.68 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  36.34 
 
 		 322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  36.22 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  34.38 
 
 		 322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  36.02 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  36.74 
 
 		 333 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.8 
 
 		 320 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.8 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.8 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.59 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.8 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.8 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.8 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  35.22 
 
 		 322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.48 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2709  hypothetical protein  35 
 
 		 322 aa  179  4e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  35.85 
 
 		 334 aa  179  4.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  35.56 
 
 		 324 aa  179  9e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2582  hypothetical protein  34.69 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  38.58 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.28 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  35.22 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.28 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  37.42 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  33.77 
 
 		 323 aa  177  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.31 
 
 		 320 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  33.44 
 
 		 323 aa  176  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  35 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  37.67 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  34.45 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.67 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  33.68 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.27 
 
 		 326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  36.09 
 
 		 330 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.65 
 
 		 320 aa  172  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  31.43 
 
 		 322 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  33.66 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  33.12 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  33.65 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  33.44 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0968  polyprenyl synthetase  36.15 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  36.45 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  32.5 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1905  Polyprenyl synthetase  44.92 
 
 		 338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  31.55 
 
 		 333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.4 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  33.66 
 
 		 324 aa  166  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  32.42 
 
 		 345 aa  166  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  34.18 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0149  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.23 
 
 		 338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  35.57 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  35.56 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  33.97 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>