More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1262 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  100 
 
 
320 aa  634    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  49.84 
 
 
320 aa  326  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  46.25 
 
 
323 aa  308  8e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  47.19 
 
 
318 aa  286  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  46.08 
 
 
322 aa  281  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  46.39 
 
 
322 aa  271  7e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  43.57 
 
 
322 aa  269  5e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  40.06 
 
 
320 aa  248  8e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  39.43 
 
 
320 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  42.41 
 
 
320 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  39.43 
 
 
320 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  39.69 
 
 
320 aa  247  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  39.12 
 
 
323 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  39.12 
 
 
323 aa  246  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  39.12 
 
 
323 aa  246  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  39.62 
 
 
320 aa  246  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  39.12 
 
 
320 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  39.12 
 
 
320 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  39.12 
 
 
320 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  40.82 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  36.15 
 
 
319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  36.15 
 
 
319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  33.13 
 
 
322 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  42.31 
 
 
321 aa  210  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  33.99 
 
 
319 aa  208  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0564  trans-hexaprenyltranstransferase  35.37 
 
 
318 aa  203  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  35.69 
 
 
322 aa  201  9e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  37.85 
 
 
317 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  34.08 
 
 
322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0389  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.16 
 
 
324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0293538  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.69 
 
 
322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  38.66 
 
 
344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_332  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.16 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  37.54 
 
 
317 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1698  polyprenyl synthetase  38.14 
 
 
349 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  39.74 
 
 
337 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  36.59 
 
 
317 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  34.94 
 
 
322 aa  192  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  37.12 
 
 
327 aa  192  5e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  34.71 
 
 
322 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1526  Polyprenyl synthetase  35.02 
 
 
318 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52823  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0369  polyprenyl synthetase  35.85 
 
 
324 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000634343  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  34.27 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  36.62 
 
 
317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  37.29 
 
 
321 aa  189  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  33.01 
 
 
322 aa  189  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5067  Trans-hexaprenyltranstransferase  39.49 
 
 
334 aa  189  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  38.78 
 
 
341 aa  189  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  38.14 
 
 
333 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  36.45 
 
 
332 aa  188  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0968  polyprenyl synthetase  35.66 
 
 
313 aa  188  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  33.97 
 
 
322 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  35.76 
 
 
331 aa  188  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.97 
 
 
323 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2323  polyprenyl synthetase  37.82 
 
 
349 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4051  polyprenyl synthetase  39.1 
 
 
356 aa  186  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  35.9 
 
 
338 aa  186  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.64 
 
 
323 aa  185  7e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  36.66 
 
 
336 aa  185  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  36.71 
 
 
323 aa  185  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  36.01 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  36.01 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.57 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  32.72 
 
 
322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  35.37 
 
 
336 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 
345 aa  182  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  36.33 
 
 
336 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  38.91 
 
 
333 aa  182  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  38.14 
 
 
340 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  37.46 
 
 
358 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  35.62 
 
 
322 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  37.8 
 
 
351 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  37.8 
 
 
340 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  35.9 
 
 
328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  35.58 
 
 
356 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  35.85 
 
 
336 aa  179  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  36.74 
 
 
336 aa  179  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4404  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.78 
 
 
331 aa  179  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  38.89 
 
 
321 aa  179  8e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  35.9 
 
 
340 aa  178  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10311  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  33.44 
 
 
323 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2345  polyprenyl synthetase  35.46 
 
 
326 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000529379  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  34.19 
 
 
322 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3342  Polyprenyl synthetase  35.28 
 
 
331 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000667178  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2582  hypothetical protein  33.33 
 
 
322 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  32.81 
 
 
323 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  31.41 
 
 
323 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2899  octaprenyl-diphosphate synthase  36.83 
 
 
322 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2709  hypothetical protein  33.33 
 
 
322 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2517  Polyprenyl synthetase  36.83 
 
 
322 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0657  polyprenyl synthetase  35.58 
 
 
333 aa  177  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0742  trans-hexaprenyltranstransferase  35.58 
 
 
333 aa  177  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.247757  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  37.1 
 
 
322 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  36.77 
 
 
327 aa  176  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  37.26 
 
 
331 aa  176  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  32.27 
 
 
324 aa  176  7e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  35.35 
 
 
335 aa  175  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  37.58 
 
 
338 aa  175  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  35.02 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0618  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  33.54 
 
 
323 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>