More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0188 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0188  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 288 aa  568  1e-161  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84444  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0787  polyprenyl synthetase  38.76 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.491944  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0764  polyprenyl synthetase  39.15 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  33.56 
 
 		 293 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  33.56 
 
 		 293 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  33.56 
 
 		 293 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  33.1 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  32.76 
 
 		 293 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  32.88 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  32.77 
 
 		 297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  31 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  32.97 
 
 		 294 aa  128  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  32.08 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  34.6 
 
 		 327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  30.92 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  30.82 
 
 		 297 aa  125  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  30.41 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  31.69 
 
 		 293 aa  125  7e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  31.51 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  32.64 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  31.8 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  30.64 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  33.6 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  31.15 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  34.72 
 
 		 290 aa  122  8e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  32.56 
 
 		 293 aa  122  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  28.04 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1037  farnesyl-diphosphate synthase  27.11 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  30.42 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  31.2 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  32.37 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0274  geranyltranstransferase  37.32 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  30.37 
 
 		 305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  31.91 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  29.11 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  34.4 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  31.82 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  32.72 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1079  geranyltranstransferase  34.31 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000871553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  31.44 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  31.44 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  33.2 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  30.35 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  35.5 
 
 		 332 aa  115  8.999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  29.35 
 
 		 294 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  30.77 
 
 		 296 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  30.57 
 
 		 309 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  29.55 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0926  farnesyl-diphosphate synthase  29.12 
 
 		 301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.19869  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  32.75 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  27.54 
 
 		 327 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  31.23 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  32.47 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0498  geranyltranstransferase, putative  32.35 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  28.03 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  31.65 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  33.06 
 
 		 327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  27.91 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  33.91 
 
 		 306 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  30.35 
 
 		 300 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2803  farnesyl-diphosphate synthase  32.76 
 
 		 293 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141503  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  31 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  32.22 
 
 		 290 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  33.46 
 
 		 320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0818  Polyprenyl synthetase  28.84 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  30.71 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2250  hypothetical protein  31.17 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  33.19 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2730  farnesyl-diphosphate synthase  32.76 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00244683  normal  0.486115 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  33.19 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2241  polyprenyl synthetase  27.31 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  0.0529545 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  29.21 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1635  geranyltranstransferase  31.7 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  31.91 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  33.78 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  25.76 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2900  farnesyl-diphosphate synthase  32.76 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0370775  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  29.6 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3122  polyprenyl synthetase  30.8 
 
 		 304 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  28.29 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  32.39 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  28.72 
 
 		 294 aa  109  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  31.82 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  33.49 
 
 		 307 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1816  geranyltranstransferase  31.32 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  33.02 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2278  hypothetical protein  31.17 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2893  geranyltranstransferase  31.2 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3252  geranyltranstransferase  32.93 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3111  geranyltranstransferase  32.93 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0754  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.93 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000103665  hitchhiker  0.0000280825 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  28.77 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  31.33 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3084  geranyltranstransferase  31.32 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2004  geranyltranstransferase  30.94 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  32.1 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3073  geranyltranstransferase  32.52 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  31.63 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>