More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0926 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0926  farnesyl-diphosphate synthase  100 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.19869  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1182  geranyltranstransferase, farnesyl diphosphate synthase  57.54 
 
 		 290 aa  293  2e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0498  geranyltranstransferase, putative  55.34 
 
 		 290 aa  280  2e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  46.1 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  45.45 
 
 		 293 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  50.21 
 
 		 307 aa  205  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  51.08 
 
 		 293 aa  203  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  51.08 
 
 		 293 aa  203  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  48.71 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  48.71 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  46.97 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  46.78 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  46.56 
 
 		 306 aa  202  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  47.46 
 
 		 297 aa  201  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  46.75 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  47.94 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  45.34 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  43.66 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  45.78 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  42.48 
 
 		 294 aa  199  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  47.57 
 
 		 296 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  47.57 
 
 		 296 aa  199  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  47.57 
 
 		 296 aa  199  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  47.57 
 
 		 296 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  47.57 
 
 		 296 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  47.19 
 
 		 296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  47.19 
 
 		 296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  47.19 
 
 		 296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  47.19 
 
 		 296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  41.95 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  43.6 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  46.75 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  45.92 
 
 		 299 aa  195  7e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  47.84 
 
 		 297 aa  195  8.000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  44.68 
 
 		 309 aa  195  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  44.53 
 
 		 320 aa  195  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  45.99 
 
 		 316 aa  195  9e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  44.22 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  44.22 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  43.18 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  43.41 
 
 		 305 aa  193  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  45.49 
 
 		 299 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  44.22 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  44.9 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  42.06 
 
 		 327 aa  192  8e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  45.82 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  46.02 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  45.69 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  44.49 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  42.97 
 
 		 294 aa  189  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  44.05 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  46.75 
 
 		 294 aa  189  5.999999999999999e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  39.72 
 
 		 308 aa  188  8e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  44.03 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  44.94 
 
 		 308 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  40 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  43.95 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  43.95 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  40.67 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  42.86 
 
 		 321 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  42.86 
 
 		 295 aa  185  7e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  44.31 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  45.38 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  46.59 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3282  polyprenyl synthetase  39.45 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  40.98 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  39.49 
 
 		 299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0068  geranyltranstransferase  43.84 
 
 		 277 aa  182  6e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.105002  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  41.09 
 
 		 308 aa  182  7e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  40.93 
 
 		 290 aa  182  7e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  45.42 
 
 		 293 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  40.54 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0088  Polyprenyl synthetase  49.1 
 
 		 311 aa  178  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0102091  normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  40.71 
 
 		 306 aa  178  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  46.12 
 
 		 294 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  45.71 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  45.71 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  40.47 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  45.71 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  45.71 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  40.96 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  40.67 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  46.12 
 
 		 294 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  40.3 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0754  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  43.23 
 
 		 288 aa  176  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000103665  hitchhiker  0.0000280825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  41.7 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  42.08 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  40.56 
 
 		 291 aa  176  5e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  42.68 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  46.15 
 
 		 296 aa  175  8e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  44.9 
 
 		 299 aa  175  9e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  44.4 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  41.67 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  42.92 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1720  polyprenyl synthetase  44.4 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0669938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1633  geranyltranstransferase  45.33 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0906165  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0218  geranyltranstransferase  45.33 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2004  geranyltranstransferase  39.93 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  45.75 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  45.26 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>