More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0068 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0068  geranyltranstransferase  100 
 
 		 277 aa  566  1e-160  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.105002  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0071  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)(FPP synthase)  58.5 
 
 		 300 aa  344  1e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.160722  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1736  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase; FPP synthase)  57.48 
 
 		 299 aa  331  9e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000234169  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0201  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)(FPP synthase)  55.8 
 
 		 284 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1816  geranyltranstransferase  55.52 
 
 		 281 aa  311  9e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1635  geranyltranstransferase  55.16 
 
 		 281 aa  308  5e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2004  geranyltranstransferase  55.16 
 
 		 281 aa  308  5e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0115  geranyltranstransferase  55.56 
 
 		 282 aa  306  2.0000000000000002e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0332253  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1934  Polyprenyl synthetase  53.43 
 
 		 286 aa  289  4e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0337  polyprenyl synthetase  50.9 
 
 		 282 aa  275  5e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  46.67 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0926  farnesyl-diphosphate synthase  43.84 
 
 		 301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.19869  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  38.04 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  39.06 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0498  geranyltranstransferase, putative  39.48 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  37.55 
 
 		 298 aa  176  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  38.52 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  42.54 
 
 		 297 aa  175  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  38.11 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  36.4 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  37.76 
 
 		 299 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  42.92 
 
 		 300 aa  171  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  43.11 
 
 		 290 aa  171  9e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  37.79 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  37.09 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0904  farnesyl-diphosphate synthase  38.91 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  36.89 
 
 		 294 aa  168  9e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  42.67 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  41.15 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  38.79 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  40.61 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  42.22 
 
 		 300 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  41.78 
 
 		 300 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  38.08 
 
 		 299 aa  165  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  38.29 
 
 		 300 aa  165  9e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  37.93 
 
 		 294 aa  165  9e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  36.82 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  42.67 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  39.92 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  39.84 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  36.82 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  39.37 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  40.85 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  38.61 
 
 		 294 aa  162  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  39.11 
 
 		 327 aa  162  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  37 
 
 		 305 aa  161  9e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2512  polyprenyl synthetase  34.92 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  35.69 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  36.51 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  35.63 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  35.63 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  34.81 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  35.63 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  41.8 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  37.64 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  35.82 
 
 		 312 aa  159  6e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  39.65 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  38.06 
 
 		 306 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  35.63 
 
 		 307 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  40.73 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  37.08 
 
 		 290 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  35.63 
 
 		 293 aa  155  9e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0613  geranyltranstransferase  37.11 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  37.55 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  35.25 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  41.18 
 
 		 298 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  37.87 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  41.3 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  38.98 
 
 		 297 aa  153  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  37.8 
 
 		 306 aa  152  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  36.72 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  36.72 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  37.8 
 
 		 306 aa  152  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  36.72 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0841  Polyprenyl synthetase  40 
 
 		 287 aa  152  5e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316383  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  33.71 
 
 		 297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  37.89 
 
 		 299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  41.26 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1146  polyprenyl synthetase  41.8 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.297824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  41.26 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  40.89 
 
 		 296 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  40.89 
 
 		 296 aa  152  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  40.89 
 
 		 296 aa  152  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  40.89 
 
 		 296 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  40.89 
 
 		 296 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  36.72 
 
 		 294 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  36.72 
 
 		 294 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  36.72 
 
 		 294 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  36.72 
 
 		 294 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  41.88 
 
 		 296 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  40.89 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  41.13 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  40.89 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  41.3 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  38.59 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  37.65 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  41.35 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  37.66 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0088  Polyprenyl synthetase  42.26 
 
 		 311 aa  149  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0102091  normal  0.401967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>