More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0787 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0787  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 272 aa  543  1e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.491944  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0764  polyprenyl synthetase  99.63 
 
 		 272 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0188  polyprenyl synthetase  38.76 
 
 		 288 aa  189  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  40.23 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  36.82 
 
 		 297 aa  165  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  39.1 
 
 		 294 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  39.59 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  39.13 
 
 		 295 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  37.83 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  36.43 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  38.66 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  37.22 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  37.7 
 
 		 299 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  37.3 
 
 		 299 aa  155  9e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  36.47 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  37.22 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  39.08 
 
 		 307 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  38.1 
 
 		 297 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  38.68 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  39.29 
 
 		 300 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  36.05 
 
 		 306 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  34.66 
 
 		 310 aa  149  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  39.25 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  39.24 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  34.08 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  37.4 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  38.17 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  37.15 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  35.69 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  36.33 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  38.79 
 
 		 309 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  38.79 
 
 		 309 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  38.11 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  35.71 
 
 		 295 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  36.73 
 
 		 305 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  35.98 
 
 		 315 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0926  farnesyl-diphosphate synthase  38.96 
 
 		 301 aa  145  8.000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.19869  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  37.75 
 
 		 290 aa  145  9e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  35.98 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  35.71 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  36.1 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1037  farnesyl-diphosphate synthase  34.62 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  35.88 
 
 		 306 aa  142  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 293 aa  142  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0498  geranyltranstransferase, putative  35.61 
 
 		 290 aa  142  7e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0274  geranyltranstransferase  36.55 
 
 		 304 aa  142  7e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  36.1 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  37.71 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1243  Polyprenyl synthetase  37.39 
 
 		 258 aa  140  3e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0818  Polyprenyl synthetase  34.3 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  36.8 
 
 		 312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0201  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)(FPP synthase)  38.37 
 
 		 284 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  35.77 
 
 		 294 aa  139  7e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  39.15 
 
 		 296 aa  138  7.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  34.85 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  35.83 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  38.63 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  35.54 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  35.56 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  34.73 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  35.54 
 
 		 293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  35.54 
 
 		 293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  37.9 
 
 		 297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  35.54 
 
 		 293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  31.82 
 
 		 293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  37.4 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  34.72 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  34.72 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  37.5 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  35.09 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  35.83 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  33.46 
 
 		 327 aa  133  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1678  Polyprenyl synthetase  34.13 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.252653  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.12 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  34.96 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  32.08 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  35.37 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  36.25 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  33.96 
 
 		 294 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  36.21 
 
 		 296 aa  132  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  36.33 
 
 		 297 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  34.17 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2201  farnesyl-diphosphate synthase  37.5 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  33.83 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  37.93 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  32.83 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  38.63 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  39.83 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  39.83 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2039  polyprenyl synthetase  35.22 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.678987  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0088  Polyprenyl synthetase  34.69 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0102091  normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3514  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  33.61 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0265  farnesyl-diphosphate synthase  35.81 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  38.21 
 
 		 297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  38.81 
 
 		 296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1707  polyprenyl synthetase  34.71 
 
 		 303 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219541  normal  0.533625 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1909  polyprenyl synthetase  36.28 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0962884  normal  0.361661 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  38.46 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  33.47 
 
 		 298 aa  129  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>