More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1707 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1707  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 303 aa  583  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219541  normal  0.533625 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4133  polyprenyl synthetase  47.08 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.812681  normal  0.156164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  45.45 
 
 		 292 aa  182  8.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  45.25 
 
 		 295 aa  179  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  45.6 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  42.45 
 
 		 321 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  44.53 
 
 		 308 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  39.66 
 
 		 297 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  41.38 
 
 		 296 aa  176  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  42.75 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  43.87 
 
 		 305 aa  176  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  42.86 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  39.72 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  41.52 
 
 		 308 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  40.43 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  41.7 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  44.86 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  40.38 
 
 		 297 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  41.33 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  42.71 
 
 		 299 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  44.49 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  43.88 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  41.45 
 
 		 337 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  39.37 
 
 		 320 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  41.04 
 
 		 295 aa  165  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  42.91 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  43.97 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0848  farnesyl-diphosphate synthase  42.27 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.840697  normal  0.407344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  41.48 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  39.46 
 
 		 307 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  43.59 
 
 		 301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 294 aa  162  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  40.3 
 
 		 294 aa  162  7e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  45.45 
 
 		 295 aa  162  8.000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  34.63 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  36.3 
 
 		 294 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  35.74 
 
 		 294 aa  161  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  34.74 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  41.85 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  37.63 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  44.98 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  38.79 
 
 		 297 aa  160  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  38.6 
 
 		 299 aa  160  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  43.32 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  39.92 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  39.92 
 
 		 299 aa  158  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  39.92 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1126  polyprenyl synthetase  44.18 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  39.72 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0205  polyprenyl synthetase  45.32 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0937506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  43.66 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1777  geranyltranstransferase  43.66 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.66005  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  39.86 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  36.97 
 
 		 300 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1712  geranyltranstransferase  43.66 
 
 		 304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  37.68 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  37.73 
 
 		 295 aa  155  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  37.68 
 
 		 296 aa  155  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  36.96 
 
 		 290 aa  155  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  38.4 
 
 		 297 aa  155  8e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1678  Polyprenyl synthetase  38.91 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.252653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  36.97 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  36.97 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  44.12 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  36.12 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  39.27 
 
 		 297 aa  153  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  42.62 
 
 		 291 aa  153  4e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  36.12 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  37.09 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1934  Polyprenyl synthetase  38.89 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1635  geranyltranstransferase  36.61 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2441  Polyprenyl synthetase  41.11 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  38.38 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  36.54 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  38.14 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  38.21 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  38.38 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  42.44 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  42.11 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  38.38 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  38.38 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  42.11 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  38.34 
 
 		 309 aa  150  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  40.08 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  36.75 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  40.35 
 
 		 310 aa  150  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  39.04 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  34.43 
 
 		 290 aa  149  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  34.43 
 
 		 290 aa  149  7e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  39.64 
 
 		 294 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2004  geranyltranstransferase  36.61 
 
 		 281 aa  149  8e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  39.64 
 
 		 294 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  36.97 
 
 		 300 aa  149  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1816  geranyltranstransferase  36.61 
 
 		 281 aa  148  9e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  39.64 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  37.32 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  43.64 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  39.64 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  37.32 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  39.64 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>