More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1816 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1816  geranyltranstransferase  100 
 
 		 281 aa  565  1e-160  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2004  geranyltranstransferase  99.29 
 
 		 281 aa  561  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1635  geranyltranstransferase  98.93 
 
 		 281 aa  560  1e-158  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0115  geranyltranstransferase  67.87 
 
 		 282 aa  384  1e-105  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0332253  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1934  Polyprenyl synthetase  59.93 
 
 		 286 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1736  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase; FPP synthase)  55.03 
 
 		 299 aa  322  6e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000234169  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0071  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)(FPP synthase)  52.35 
 
 		 300 aa  319  3e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.160722  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0201  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)(FPP synthase)  55.87 
 
 		 284 aa  312  2.9999999999999996e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0068  geranyltranstransferase  55.52 
 
 		 277 aa  311  9e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.105002  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0337  polyprenyl synthetase  52.35 
 
 		 282 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0498  geranyltranstransferase, putative  41.22 
 
 		 290 aa  185  7e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  40.38 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  42.41 
 
 		 294 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  40.52 
 
 		 295 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  39.41 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  38.46 
 
 		 297 aa  175  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  42.11 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0926  farnesyl-diphosphate synthase  39.55 
 
 		 301 aa  172  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.19869  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  40.43 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  38.64 
 
 		 290 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  38.64 
 
 		 290 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  37.97 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  35.25 
 
 		 294 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  40.47 
 
 		 306 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  40.07 
 
 		 299 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  38.66 
 
 		 294 aa  168  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  39.67 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  39.3 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  41.74 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  39.3 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  36.63 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  38.93 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  38.55 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  38.55 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  38.55 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  44.44 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  34.48 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  38.7 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  41.22 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  39.42 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  35.82 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  35.38 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  40 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  38.96 
 
 		 300 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  37.64 
 
 		 299 aa  162  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  38.66 
 
 		 305 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  38.7 
 
 		 293 aa  161  9e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  38.7 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  41.6 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  37.23 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  38.13 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  38.55 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  40.32 
 
 		 294 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  37.74 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  40.76 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  37.35 
 
 		 337 aa  159  5e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  36.07 
 
 		 294 aa  157  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  38.62 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  39.37 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  42.98 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  38.87 
 
 		 300 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  36.43 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2512  polyprenyl synthetase  34.38 
 
 		 335 aa  156  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  37.01 
 
 		 293 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  39.68 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  40.08 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  42.41 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  42.41 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  41.23 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  37.64 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  34.2 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  36.06 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  41.23 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  41.23 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  41.23 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  41.23 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  41.23 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1774  Polyprenyl synthetase  37.08 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.284525  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  40.08 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  37.13 
 
 		 307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  41.37 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  41.23 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  41.23 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  38.33 
 
 		 297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  36.36 
 
 		 294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  37.3 
 
 		 293 aa  152  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1678  Polyprenyl synthetase  40 
 
 		 309 aa  152  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.252653  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  40.18 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  36.8 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  38.65 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  35.69 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  35.5 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  38.15 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  40.32 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0088  Polyprenyl synthetase  38.46 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0102091  normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  38.52 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  37.25 
 
 		 337 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  36.03 
 
 		 320 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  40.65 
 
 		 295 aa  149  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01174  geranyltranstransferase  42.11 
 
 		 294 aa  149  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>