More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2039 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2039  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 288 aa  578  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.678987  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0265  farnesyl-diphosphate synthase  97.22 
 
 		 288 aa  547  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1909  polyprenyl synthetase  96.88 
 
 		 292 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0962884  normal  0.361661 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0182  farnesyl-diphosphate synthase  71.53 
 
 		 290 aa  383  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3514  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  67.26 
 
 		 292 aa  363  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2821  polyprenyl synthetase  56.79 
 
 		 289 aa  278  7e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230179  normal  0.537007 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4004  polyprenyl synthetase  53.33 
 
 		 287 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.669226  hitchhiker  0.00057094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1707  Polyprenyl synthetase  51.05 
 
 		 288 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6440  farnesyl-diphosphate synthase  50.17 
 
 		 289 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3759  polyprenyl synthetase  53.33 
 
 		 288 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492554 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2983  farnesyl-diphosphate synthase  51.93 
 
 		 289 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313426  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3694  polyprenyl synthetase  55.52 
 
 		 290 aa  257  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.816897  hitchhiker  0.00301236 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1613  polyprenyl synthetase  54.06 
 
 		 291 aa  257  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1290  polyprenyl synthetase  52.63 
 
 		 288 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.168038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2954  Polyprenyl synthetase  54.72 
 
 		 288 aa  249  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0123408  normal  0.0660795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2849  Polyprenyl synthetase  53.17 
 
 		 288 aa  246  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2727  polyprenyl synthetase  54.41 
 
 		 288 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0712991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2049  Polyprenyl synthetase  51.52 
 
 		 289 aa  241  9e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.413554 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  41.43 
 
 		 300 aa  162  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  35.86 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  39.37 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  35.56 
 
 		 300 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  36.8 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  34.46 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  39.85 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  41.74 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  33.92 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  34.83 
 
 		 300 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  36.76 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  33.92 
 
 		 293 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  33.92 
 
 		 293 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  33.92 
 
 		 293 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  40.5 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  39.04 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  35.36 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  37.92 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  34.03 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  34.6 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  40.91 
 
 		 291 aa  145  5e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  34.62 
 
 		 293 aa  146  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  39.17 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3282  polyprenyl synthetase  37.2 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  36.26 
 
 		 306 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  38.11 
 
 		 302 aa  145  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  40.15 
 
 		 294 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  40.15 
 
 		 294 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  40.15 
 
 		 294 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  40.15 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  40.15 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  40.15 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  40.68 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  39.43 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  38.91 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  40.15 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  37.09 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2034  Polyprenyl synthetase  44.83 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  33.22 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  34.98 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  39.83 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  36.82 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  39.25 
 
 		 327 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  38.27 
 
 		 321 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  34.46 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  40.3 
 
 		 294 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  39.33 
 
 		 306 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  40.3 
 
 		 294 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  40.3 
 
 		 294 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  33.33 
 
 		 293 aa  142  5e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  34.8 
 
 		 294 aa  142  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  39.38 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  42.29 
 
 		 286 aa  142  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  35.09 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  40.93 
 
 		 290 aa  142  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  37.92 
 
 		 308 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  37.4 
 
 		 299 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  39.54 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  37.01 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  35.66 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  39.85 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  37.45 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  39.92 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2222  geranyltranstransferase  42.86 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2228  polyprenyl synthetase  36.3 
 
 		 360 aa  140  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  40.23 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  31.5 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  34.69 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  35.16 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  39.85 
 
 		 294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  35.17 
 
 		 294 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  35.56 
 
 		 293 aa  139  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2512  polyprenyl synthetase  31.73 
 
 		 335 aa  139  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2241  polyprenyl synthetase  39.68 
 
 		 316 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  0.0529545 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0613  geranyltranstransferase  39 
 
 		 294 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2427  Polyprenyl synthetase  42.42 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  32.95 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  34.2 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  32.29 
 
 		 298 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  38.11 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  30.8 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  39.04 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>