More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1243 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1243  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 258 aa  523  1e-147  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  40.38 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  39.08 
 
 		 296 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  38.35 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  39.62 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  39.53 
 
 		 301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  38.49 
 
 		 307 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  40.62 
 
 		 294 aa  159  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  39.52 
 
 		 309 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  39.52 
 
 		 309 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  40.34 
 
 		 300 aa  158  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  40.18 
 
 		 316 aa  155  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  37.66 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  44.34 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  39.11 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  37.24 
 
 		 299 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  37.02 
 
 		 306 aa  151  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  40.87 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  40.27 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  39.08 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  40.38 
 
 		 295 aa  149  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  36.82 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  35.51 
 
 		 308 aa  149  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  39.3 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  33.82 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  38.94 
 
 		 294 aa  148  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  37.98 
 
 		 300 aa  148  9e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  37.55 
 
 		 300 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  37.17 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  39.52 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  35.51 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  37.12 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  36.68 
 
 		 300 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  42.86 
 
 		 290 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  38.54 
 
 		 295 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  38.96 
 
 		 290 aa  145  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  37.26 
 
 		 321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  35 
 
 		 296 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  37.9 
 
 		 337 aa  144  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  37.79 
 
 		 286 aa  143  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  38.46 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  32.79 
 
 		 307 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  36.22 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  38.96 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  37.39 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0787  polyprenyl synthetase  37.39 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.491944  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  34.96 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  35.27 
 
 		 308 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  36.89 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  37.21 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  35.8 
 
 		 306 aa  138  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0764  polyprenyl synthetase  37.1 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  33.77 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0818  Polyprenyl synthetase  35.22 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  41.9 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  32.78 
 
 		 293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  40.49 
 
 		 296 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  35.84 
 
 		 327 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  38.64 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  35.1 
 
 		 305 aa  136  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  36.04 
 
 		 297 aa  135  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  34.15 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  40 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  34.01 
 
 		 301 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0841  Polyprenyl synthetase  44.29 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316383  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  34.13 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  41.35 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  37.55 
 
 		 310 aa  132  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  38.5 
 
 		 298 aa  131  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0848  farnesyl-diphosphate synthase  35.8 
 
 		 295 aa  132  7.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.840697  normal  0.407344 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2250  hypothetical protein  34 
 
 		 298 aa  131  9e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  39.22 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  31.97 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  37.45 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  33.21 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  36.15 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  35.65 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2278  hypothetical protein  34 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0267  polyprenyl synthetase  36.64 
 
 		 334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.879349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.5 
 
 		 296 aa  129  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0942  Polyprenyl synthetase  40.65 
 
 		 295 aa  129  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  39.33 
 
 		 297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  36.15 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  32.33 
 
 		 308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  38.49 
 
 		 296 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  38.49 
 
 		 296 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  32.82 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1678  Polyprenyl synthetase  34.88 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.252653  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  40.48 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2241  polyprenyl synthetase  37.4 
 
 		 316 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  0.0529545 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  39.65 
 
 		 296 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  39.65 
 
 		 296 aa  126  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  39.65 
 
 		 296 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  39.65 
 
 		 296 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  35.83 
 
 		 298 aa  126  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  39.65 
 
 		 296 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  38.08 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  30.74 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  37.13 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>