More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2278 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2278  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  605  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2250  hypothetical protein  97.32 
 
 		 298 aa  588  1e-167  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  45.63 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  45.24 
 
 		 293 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  45.24 
 
 		 293 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  45.24 
 
 		 293 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  40.85 
 
 		 291 aa  209  5e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  40.79 
 
 		 291 aa  209  5e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  46.46 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  42.34 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  42.86 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  43.92 
 
 		 293 aa  202  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  40.27 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  40.53 
 
 		 296 aa  199  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  41.03 
 
 		 306 aa  199  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  48.68 
 
 		 293 aa  200  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  43.65 
 
 		 293 aa  198  7e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  39.19 
 
 		 294 aa  198  7.999999999999999e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  41.34 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  42.86 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  43.75 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  42.28 
 
 		 298 aa  195  6e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  40 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  41.96 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  38.41 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  38.41 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  40.07 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  43.45 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  40.07 
 
 		 294 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  40.07 
 
 		 294 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  40.07 
 
 		 294 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  41.09 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  39.38 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1320  polyprenyl synthetase  45.34 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  39.67 
 
 		 300 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  39.04 
 
 		 294 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  39.38 
 
 		 294 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  39.15 
 
 		 290 aa  185  6e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  41.9 
 
 		 292 aa  185  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  41.53 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  42.8 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  37.41 
 
 		 295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  40.62 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  40.23 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  38.19 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  39.73 
 
 		 293 aa  178  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  39.39 
 
 		 293 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  42.07 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0904  farnesyl-diphosphate synthase  40.34 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  37.76 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  37.76 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  37.76 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01426  geranyltranstransferase  39.16 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.631666  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  37.76 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2900  farnesyl-diphosphate synthase  42.75 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0370775  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  37.76 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  37.76 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  37.76 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  36.84 
 
 		 305 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  41.85 
 
 		 327 aa  176  6e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2803  farnesyl-diphosphate synthase  42.38 
 
 		 293 aa  175  8e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141503  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1089  geranyltranstransferase  39.46 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0613  geranyltranstransferase  38.91 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2730  farnesyl-diphosphate synthase  42.38 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00244683  normal  0.486115 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  36.58 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  40.56 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  36.61 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  40.49 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  35.96 
 
 		 297 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0098  farnesyl-diphosphate synthase  41.05 
 
 		 285 aa  172  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0880  farnesyl-diphosphate synthase  42.03 
 
 		 296 aa  172  5.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  41.7 
 
 		 306 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  40.61 
 
 		 293 aa  172  9e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  35.57 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  34.9 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  36.58 
 
 		 308 aa  170  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  37.71 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  37.55 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  40.35 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  39.02 
 
 		 316 aa  170  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  37.25 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  37.33 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  41.2 
 
 		 295 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  37.16 
 
 		 295 aa  169  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  37.37 
 
 		 300 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1678  Polyprenyl synthetase  37.46 
 
 		 309 aa  168  9e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.252653  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  37.92 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  39.17 
 
 		 295 aa  167  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  40.37 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01174  geranyltranstransferase  41.9 
 
 		 294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  39.16 
 
 		 296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1146  polyprenyl synthetase  42.34 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.297824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  38.58 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2570  polyprenyl synthetase  43.19 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0334175  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3282  polyprenyl synthetase  38.43 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2239  geranyltranstransferase  40.93 
 
 		 296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2241  polyprenyl synthetase  41.77 
 
 		 316 aa  165  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  0.0529545 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  41.44 
 
 		 295 aa  165  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  37.28 
 
 		 307 aa  165  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2132  farnesyl-diphosphate synthase  38.89 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.47194  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>