More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2239 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2239  geranyltranstransferase  100 
 
 		 296 aa  601  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  59.79 
 
 		 293 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  58.76 
 
 		 293 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  58.42 
 
 		 293 aa  334  7.999999999999999e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  57.04 
 
 		 293 aa  334  9e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  56.01 
 
 		 293 aa  331  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  56.01 
 
 		 293 aa  331  9e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  56.01 
 
 		 293 aa  331  9e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  56.01 
 
 		 293 aa  331  9e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  58.42 
 
 		 293 aa  330  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  58.7 
 
 		 294 aa  330  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  57.39 
 
 		 293 aa  329  3e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  59.04 
 
 		 294 aa  325  5e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  56.01 
 
 		 293 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  57.14 
 
 		 293 aa  319  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  56.85 
 
 		 298 aa  317  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2730  farnesyl-diphosphate synthase  56.01 
 
 		 293 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00244683  normal  0.486115 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01174  geranyltranstransferase  60.75 
 
 		 294 aa  300  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2900  farnesyl-diphosphate synthase  56.01 
 
 		 293 aa  299  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0370775  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  58.96 
 
 		 299 aa  298  7e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2803  farnesyl-diphosphate synthase  56.01 
 
 		 293 aa  298  7e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141503  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0470  geranyltranstransferase  61.28 
 
 		 299 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0525  geranyltranstransferase  61.28 
 
 		 299 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0462  geranyltranstransferase  60.9 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0464  geranyltranstransferase  60.9 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0483  geranyltranstransferase  60.9 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3084  geranyltranstransferase  54.13 
 
 		 303 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0888  geranyltranstransferase  57.93 
 
 		 299 aa  283  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1031  geranyltranstransferase  54.1 
 
 		 303 aa  282  5.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  51.74 
 
 		 306 aa  281  7.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  49.66 
 
 		 299 aa  281  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2570  polyprenyl synthetase  55.97 
 
 		 293 aa  280  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0334175  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3111  geranyltranstransferase  57.48 
 
 		 306 aa  278  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3280  geranyltranstransferase  53.95 
 
 		 303 aa  278  9e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3252  geranyltranstransferase  57.14 
 
 		 306 aa  276  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3073  geranyltranstransferase  57.48 
 
 		 306 aa  276  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2893  geranyltranstransferase  53.77 
 
 		 303 aa  275  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0504  geranyltranstransferase  59.7 
 
 		 299 aa  275  9e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0492  geranyltranstransferase  59.4 
 
 		 299 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  47.96 
 
 		 296 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0452  geranyltranstransferase  59.4 
 
 		 299 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00369  geranyltranstransferase  59.33 
 
 		 299 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3188  Polyprenyl synthetase  59.33 
 
 		 299 aa  273  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.574686  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00373  hypothetical protein  59.33 
 
 		 299 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0457  geranyltranstransferase  59.33 
 
 		 299 aa  273  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.914114 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0342  geranyltranstransferase  59.33 
 
 		 299 aa  273  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1089  geranyltranstransferase  51.72 
 
 		 300 aa  268  7e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1320  polyprenyl synthetase  53.87 
 
 		 296 aa  267  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0904  farnesyl-diphosphate synthase  50.33 
 
 		 296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1079  geranyltranstransferase  54.67 
 
 		 306 aa  261  8e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000871553 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  48.28 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  49.62 
 
 		 294 aa  247  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  47.47 
 
 		 306 aa  245  6e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  47.47 
 
 		 306 aa  245  6e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  42.81 
 
 		 294 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  45.8 
 
 		 292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  48.12 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0098  farnesyl-diphosphate synthase  50.17 
 
 		 285 aa  237  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01426  geranyltranstransferase  47.74 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.631666  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  43.84 
 
 		 295 aa  234  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  44.18 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  43.69 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  43.69 
 
 		 299 aa  232  5e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  43.69 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  44.67 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  42.71 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5006  farnesyl-diphosphate synthase  50.7 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0274  geranyltranstransferase  48.06 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1146  polyprenyl synthetase  50.51 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.297824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  44.95 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  42.66 
 
 		 300 aa  225  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  49.3 
 
 		 295 aa  225  7e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  49.65 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  49.48 
 
 		 295 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  49.48 
 
 		 295 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  41.55 
 
 		 300 aa  222  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  47.45 
 
 		 291 aa  222  6e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  43.21 
 
 		 297 aa  222  7e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  47.39 
 
 		 298 aa  221  8e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  42.03 
 
 		 305 aa  221  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  50.88 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0573  polyprenyl synthetase  50.52 
 
 		 295 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  47.08 
 
 		 291 aa  220  3e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  41.39 
 
 		 300 aa  219  3e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  42.21 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  42.51 
 
 		 297 aa  219  5e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  43.13 
 
 		 290 aa  219  5e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  48.94 
 
 		 295 aa  219  6e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  40.53 
 
 		 300 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  47.12 
 
 		 295 aa  218  7.999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  41.1 
 
 		 293 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  50 
 
 		 295 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  50 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11560  geranyltranstransferase  49.3 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  45.45 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0880  farnesyl-diphosphate synthase  45.24 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  40.82 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  44.56 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  41.36 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1985  polyprenyl synthetase  44.63 
 
 		 307 aa  211  9e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>