More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0274 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007984  BCI_0274  geranyltranstransferase  100 
 
 		 304 aa  622  1e-177  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  48.82 
 
 		 299 aa  279  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  49.5 
 
 		 294 aa  279  5e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1031  geranyltranstransferase  53.33 
 
 		 303 aa  276  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3111  geranyltranstransferase  52.01 
 
 		 306 aa  271  7e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3252  geranyltranstransferase  52.01 
 
 		 306 aa  271  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3280  geranyltranstransferase  52.67 
 
 		 303 aa  271  8.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2893  geranyltranstransferase  50.67 
 
 		 303 aa  271  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3084  geranyltranstransferase  51.33 
 
 		 303 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3073  geranyltranstransferase  52.01 
 
 		 306 aa  270  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  48.67 
 
 		 294 aa  268  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1079  geranyltranstransferase  52.54 
 
 		 306 aa  266  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000871553 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  47.87 
 
 		 298 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0525  geranyltranstransferase  49.66 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0464  geranyltranstransferase  49.66 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0483  geranyltranstransferase  49.66 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0470  geranyltranstransferase  49.66 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0462  geranyltranstransferase  49.66 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00369  geranyltranstransferase  48.32 
 
 		 299 aa  255  5e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3188  Polyprenyl synthetase  48.32 
 
 		 299 aa  255  5e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.574686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0342  geranyltranstransferase  48.32 
 
 		 299 aa  255  5e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0457  geranyltranstransferase  48.32 
 
 		 299 aa  255  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.914114 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00373  hypothetical protein  48.32 
 
 		 299 aa  255  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0492  geranyltranstransferase  48.48 
 
 		 299 aa  255  6e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0452  geranyltranstransferase  48.48 
 
 		 299 aa  255  6e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0504  geranyltranstransferase  48.32 
 
 		 299 aa  255  6e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01174  geranyltranstransferase  52.36 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0888  geranyltranstransferase  49.49 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  47.28 
 
 		 293 aa  242  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  46.94 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  46.94 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  46.94 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  48.1 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  46.6 
 
 		 293 aa  235  6e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  46.26 
 
 		 293 aa  234  9e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  44.75 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  45.21 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  44.59 
 
 		 293 aa  226  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  43.94 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  44.01 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  45.26 
 
 		 293 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  47.86 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  44.97 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  43.62 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1320  polyprenyl synthetase  43.05 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  44.33 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2900  farnesyl-diphosphate synthase  46.26 
 
 		 293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0370775  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2803  farnesyl-diphosphate synthase  46.26 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141503  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0904  farnesyl-diphosphate synthase  44.44 
 
 		 296 aa  212  5.999999999999999e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  46.44 
 
 		 295 aa  209  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2730  farnesyl-diphosphate synthase  45.92 
 
 		 293 aa  209  6e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00244683  normal  0.486115 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0098  farnesyl-diphosphate synthase  48.5 
 
 		 285 aa  208  7e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2239  geranyltranstransferase  48.06 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  42.95 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  42.81 
 
 		 300 aa  202  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  40.89 
 
 		 291 aa  202  5e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  41.24 
 
 		 291 aa  202  6e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  40.85 
 
 		 308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  43.36 
 
 		 295 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  42 
 
 		 294 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  41.18 
 
 		 308 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  42.16 
 
 		 303 aa  198  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  42.7 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  43.01 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  42.62 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  42.62 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2570  polyprenyl synthetase  44.33 
 
 		 293 aa  195  7e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0334175  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5006  farnesyl-diphosphate synthase  45.15 
 
 		 295 aa  195  9e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  40.85 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  38.96 
 
 		 307 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  43.68 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  41.96 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0573  polyprenyl synthetase  42.66 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  41.81 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  41.11 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  43.08 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  42.81 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  39.93 
 
 		 294 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  39.93 
 
 		 294 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  39.93 
 
 		 294 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  41.67 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  42.27 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  41.45 
 
 		 321 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1089  geranyltranstransferase  44.24 
 
 		 300 aa  189  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  39.6 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  39.6 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  39.6 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  39.6 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1146  polyprenyl synthetase  48.64 
 
 		 293 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.297824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  39 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  41.72 
 
 		 306 aa  186  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  41.72 
 
 		 306 aa  186  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  38.89 
 
 		 290 aa  186  6e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  44.4 
 
 		 295 aa  185  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2791  polyprenyl synthetase  44.44 
 
 		 289 aa  185  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0405242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0880  farnesyl-diphosphate synthase  42.28 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  46.36 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  45.31 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  39.29 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  38.78 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>