More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0201 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0201  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)(FPP synthase)  100 
 
 		 284 aa  578  1e-164  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0071  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)(FPP synthase)  56 
 
 		 300 aa  332  6e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.160722  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1736  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase; FPP synthase)  55.52 
 
 		 299 aa  318  7e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000234169  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1635  geranyltranstransferase  55.87 
 
 		 281 aa  313  9.999999999999999e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2004  geranyltranstransferase  55.87 
 
 		 281 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0068  geranyltranstransferase  55.8 
 
 		 277 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.105002  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1816  geranyltranstransferase  55.87 
 
 		 281 aa  312  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0115  geranyltranstransferase  54.29 
 
 		 282 aa  299  3e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0332253  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1934  Polyprenyl synthetase  49.3 
 
 		 286 aa  275  8e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0337  polyprenyl synthetase  47.31 
 
 		 282 aa  243  3e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  41.6 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  44.25 
 
 		 296 aa  176  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  39.93 
 
 		 300 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  41.77 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  41.35 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  42.45 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0926  farnesyl-diphosphate synthase  36.96 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.19869  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  40.82 
 
 		 306 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  38.89 
 
 		 293 aa  169  6e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  40.94 
 
 		 299 aa  169  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  39.7 
 
 		 295 aa  168  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  37.59 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  40.16 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  37.54 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  38.64 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  42.79 
 
 		 297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  39.43 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  40.23 
 
 		 300 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  39.53 
 
 		 300 aa  165  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  39.45 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  43.66 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  39.69 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  38.84 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  39.83 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  36.4 
 
 		 306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  37.68 
 
 		 296 aa  162  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  40.31 
 
 		 300 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  35.34 
 
 		 292 aa  162  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  43.42 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1388  polyprenyl synthetase  42.39 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  41.23 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0498  geranyltranstransferase, putative  36.19 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0218  geranyltranstransferase  32.95 
 
 		 322 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1633  geranyltranstransferase  32.95 
 
 		 322 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0906165  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  35.41 
 
 		 315 aa  159  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  37.39 
 
 		 295 aa  159  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  40.6 
 
 		 316 aa  159  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  37.8 
 
 		 290 aa  159  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1720  polyprenyl synthetase  32.95 
 
 		 322 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0669938  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  36.51 
 
 		 295 aa  159  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  38.59 
 
 		 297 aa  158  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  38.98 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  40.43 
 
 		 309 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  40.43 
 
 		 309 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  35.38 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  38.43 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  35.85 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  35.38 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  35.38 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  35.36 
 
 		 306 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  35.38 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  36.72 
 
 		 293 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  36.33 
 
 		 293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  39.11 
 
 		 299 aa  155  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  38.4 
 
 		 294 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  38.4 
 
 		 294 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  38.31 
 
 		 294 aa  155  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  38.4 
 
 		 294 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  38.4 
 
 		 294 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  38.02 
 
 		 293 aa  155  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  39.11 
 
 		 297 aa  155  9e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  33.71 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  39.83 
 
 		 320 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2512  polyprenyl synthetase  35.27 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  37.88 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  36.29 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  35.23 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  37.6 
 
 		 293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  35.23 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  35.23 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  39.41 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  34.21 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  34.67 
 
 		 294 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  35.23 
 
 		 294 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  35.23 
 
 		 294 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  35.23 
 
 		 294 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  35.23 
 
 		 294 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  39.41 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  37.93 
 
 		 298 aa  152  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  37.97 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  34.21 
 
 		 291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  43.04 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  40.54 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  40.54 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  37.55 
 
 		 294 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  40 
 
 		 297 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  37.89 
 
 		 296 aa  151  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  38.11 
 
 		 293 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  36.86 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  38.91 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>