More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3189 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3189  trans-hexaprenyltranstransferase  100 
 
 		 322 aa  653    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0208  trans-hexaprenyltranstransferase  63.35 
 
 		 321 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.647597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2490  Polyprenyl synthetase  62.01 
 
 		 331 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  47.35 
 
 		 322 aa  290  3e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3011  Polyprenyl synthetase  50.65 
 
 		 326 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1912  Polyprenyl synthetase  50 
 
 		 321 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  37.77 
 
 		 336 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  37.04 
 
 		 336 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  35.78 
 
 		 336 aa  210  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  36.09 
 
 		 336 aa  209  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  37.8 
 
 		 335 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  36.34 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  36.89 
 
 		 336 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  36.84 
 
 		 336 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  37.07 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  36.73 
 
 		 322 aa  196  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  37.29 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  35.4 
 
 		 322 aa  193  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  36.48 
 
 		 322 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  35.2 
 
 		 336 aa  189  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  35.31 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  34.38 
 
 		 356 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  36.48 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  36.48 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  36.73 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  35.71 
 
 		 328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  36.16 
 
 		 322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  33.76 
 
 		 339 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.05 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  35.58 
 
 		 340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  35.69 
 
 		 351 aa  182  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  35.58 
 
 		 340 aa  182  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2749  polyprenyl synthetase  33.74 
 
 		 345 aa  182  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0535555  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4378  Polyprenyl synthetase  35.13 
 
 		 345 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  34.47 
 
 		 322 aa  182  9.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  37.28 
 
 		 327 aa  180  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  36.86 
 
 		 322 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  35.64 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  37.2 
 
 		 322 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  33.23 
 
 		 337 aa  180  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  35.33 
 
 		 336 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  36.18 
 
 		 322 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  34.47 
 
 		 322 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  36.31 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  36.18 
 
 		 322 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.31 
 
 		 323 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  39.11 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  34.89 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  34.13 
 
 		 335 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  39 
 
 		 345 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  37.88 
 
 		 322 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  32.25 
 
 		 327 aa  176  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  33.87 
 
 		 344 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  32.83 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  34.32 
 
 		 313 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  36.48 
 
 		 318 aa  172  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  33.23 
 
 		 338 aa  173  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  32.21 
 
 		 317 aa  172  6.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  37.73 
 
 		 342 aa  172  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0722  polyprenyl synthetase  34.85 
 
 		 339 aa  172  7.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  33.55 
 
 		 322 aa  172  9e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  39.19 
 
 		 322 aa  172  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  35.85 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  33.54 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0458  polyprenyl synthetase  34.2 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.480075 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  34.86 
 
 		 322 aa  170  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  31.8 
 
 		 341 aa  169  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  35.09 
 
 		 323 aa  169  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1137  trans-hexaprenyltranstransferase  34.44 
 
 		 323 aa  169  6e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  31.82 
 
 		 323 aa  169  6e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  33.68 
 
 		 337 aa  169  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  37.55 
 
 		 334 aa  168  9e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  35.49 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0752  trans-hexaprenyltranstransferase  37.19 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130726 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  33.44 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  33.76 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0912  Polyprenyl synthetase  32.37 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0418451  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0567  Farnesyltranstransferase  32.81 
 
 		 338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  38.11 
 
 		 322 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  36.23 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  33.22 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  34.47 
 
 		 334 aa  166  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  38.53 
 
 		 359 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0523  Polyprenyl synthetase  32.81 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.057969  normal  0.393199 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  33.01 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  39.34 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  36.89 
 
 		 323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  33.89 
 
 		 326 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  36.89 
 
 		 323 aa  165  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18951  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.22 
 
 		 323 aa  165  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  32.04 
 
 		 348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  34.36 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0840  trans-hexaprenyltranstransferase  36.96 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.24671  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  32.92 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  38.52 
 
 		 322 aa  164  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  32.65 
 
 		 323 aa  164  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.18 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0943  octaprenyl-diphosphate synthase  33.23 
 
 		 338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.560813  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  31.83 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  32.9 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>