More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2490 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2490  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 331 aa  660    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0208  trans-hexaprenyltranstransferase  70.21 
 
 		 321 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.647597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3189  trans-hexaprenyltranstransferase  62.01 
 
 		 322 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1912  Polyprenyl synthetase  52.58 
 
 		 321 aa  295  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  47.73 
 
 		 322 aa  289  4e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3011  Polyprenyl synthetase  51.68 
 
 		 326 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  38.29 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  38.29 
 
 		 322 aa  209  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  36.71 
 
 		 322 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  35.78 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2749  polyprenyl synthetase  35.67 
 
 		 345 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0535555  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4378  Polyprenyl synthetase  36.56 
 
 		 345 aa  199  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  36.21 
 
 		 322 aa  199  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  35.65 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  34.36 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  35.58 
 
 		 335 aa  195  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  35.4 
 
 		 336 aa  195  8.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  35.47 
 
 		 336 aa  195  9e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  33.64 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  36.39 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  35.4 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  35.74 
 
 		 356 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  35.74 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  35.42 
 
 		 340 aa  192  5e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  35.76 
 
 		 322 aa  192  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  35.47 
 
 		 340 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  35.09 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  35.09 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  34.47 
 
 		 351 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.08 
 
 		 320 aa  190  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  34.48 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  36.19 
 
 		 322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  33.64 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  37.14 
 
 		 322 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  34.78 
 
 		 322 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  33.74 
 
 		 336 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  33.64 
 
 		 336 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  34.86 
 
 		 340 aa  189  8e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  38.6 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  38.61 
 
 		 322 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  35.56 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  37.7 
 
 		 330 aa  186  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  35.64 
 
 		 332 aa  186  5e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  34.76 
 
 		 333 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  34.45 
 
 		 333 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0458  polyprenyl synthetase  35.62 
 
 		 338 aa  186  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.480075 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  36.05 
 
 		 323 aa  186  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  33.33 
 
 		 336 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  34.45 
 
 		 333 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0722  polyprenyl synthetase  35.56 
 
 		 339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  35.31 
 
 		 332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  34.85 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  39.3 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  37.95 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  39.92 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  36.09 
 
 		 344 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  34.13 
 
 		 322 aa  182  9.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  35.06 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  35.88 
 
 		 332 aa  180  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  37.38 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  37.08 
 
 		 318 aa  180  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  35.91 
 
 		 358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  32.93 
 
 		 331 aa  179  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  31.55 
 
 		 323 aa  179  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  35.14 
 
 		 322 aa  179  8e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  34.24 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  34.98 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  37.54 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  37.16 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  33.64 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  37.42 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  34.38 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.54 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  37.31 
 
 		 327 aa  176  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  33.99 
 
 		 313 aa  176  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  33.44 
 
 		 337 aa  176  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  32.15 
 
 		 317 aa  176  7e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  34.87 
 
 		 334 aa  176  7e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  33 
 
 		 324 aa  176  7e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  33.12 
 
 		 322 aa  175  8e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  32.29 
 
 		 323 aa  175  8e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.76 
 
 		 325 aa  175  9e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  33.94 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  30.91 
 
 		 323 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  35.26 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  35.85 
 
 		 322 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0523  Polyprenyl synthetase  34.8 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.057969  normal  0.393199 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  33.44 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0567  Farnesyltranstransferase  34.8 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  39.51 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  33.12 
 
 		 324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  36.42 
 
 		 327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  32.81 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  31.37 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  32.49 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  32.49 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  32.49 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  32.49 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  32.49 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  32.49 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>