More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2956 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2956  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 308 aa  619  1e-176  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.660662  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  34.95 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  34.14 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  33.9 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  33.33 
 
 		 331 aa  139  6e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  34.13 
 
 		 330 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  33.92 
 
 		 320 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  33.45 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  31.27 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  33.54 
 
 		 322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  31.25 
 
 		 317 aa  133  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  33.54 
 
 		 322 aa  132  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  32.65 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  31.11 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  30.7 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.99 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  32.19 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  36.29 
 
 		 327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  31.47 
 
 		 327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.59 
 
 		 320 aa  129  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  32.19 
 
 		 317 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  30 
 
 		 322 aa  128  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  29.93 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  30.93 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  31.25 
 
 		 326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  30.6 
 
 		 322 aa  125  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  30.42 
 
 		 322 aa  125  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  30.28 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  29.82 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  31.47 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  30.21 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  28.92 
 
 		 325 aa  123  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1526  Polyprenyl synthetase  28.99 
 
 		 318 aa  122  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52823  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  30.84 
 
 		 346 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  28.32 
 
 		 320 aa  122  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3242  Polyprenyl synthetase  32.46 
 
 		 354 aa  122  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.650754  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  34.21 
 
 		 324 aa  122  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2538  Dimethylallyltranstransferase  33.44 
 
 		 349 aa  122  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  31.38 
 
 		 320 aa  122  9e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  34.04 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  31.98 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  31 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  29.97 
 
 		 335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  28.04 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  33.45 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1206  polyprenyl synthetase  33.02 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.513986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  31.67 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0564  trans-hexaprenyltranstransferase  29.45 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  34.36 
 
 		 330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  30.45 
 
 		 322 aa  119  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  29.02 
 
 		 324 aa  119  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  30.77 
 
 		 323 aa  119  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  30.66 
 
 		 323 aa  119  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  29.97 
 
 		 323 aa  119  9e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  32.42 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05420  polyprenyl synthetase  29.27 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.242903  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  31.35 
 
 		 346 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  29.02 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  29.33 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  30.07 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  28.79 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  28.57 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  31.35 
 
 		 348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1784  polyprenyl synthetase  28.57 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.60288  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  30.1 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  28.77 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  29.76 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  29.76 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  29.76 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  28.18 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  29.76 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  29.76 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  29.76 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  29.76 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  29.41 
 
 		 323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0637  polyprenyl synthetase  29.82 
 
 		 340 aa  116  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3006  Trans-hexaprenyltranstransferase  27.87 
 
 		 324 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  28.92 
 
 		 322 aa  116  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  29.62 
 
 		 370 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  29.62 
 
 		 370 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  29.62 
 
 		 370 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  29.62 
 
 		 370 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  29.62 
 
 		 370 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  35.51 
 
 		 324 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2049  Polyprenyl synthetase  29.91 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000493992  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1998  polyprenyl synthetase  31.12 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.553605 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  29.11 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  32.19 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  29.72 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.79 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2084  Polyprenyl synthetase  27.15 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.235717  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  31.72 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1909  Polyprenyl synthetase  34.43 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0724132  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  32.2 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.28 
 
 		 364 aa  113  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0645  polyprenyl synthetase family protein  32.04 
 
 		 297 aa  113  5e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0989219  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2608  Polyprenyl synthetase  31.61 
 
 		 344 aa  112  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  0.754762 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  31.42 
 
 		 324 aa  112  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0566  polyprenyl synthetase family protein  32.04 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.293627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>