More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0566 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0566  polyprenyl synthetase family protein  100 
 
 		 297 aa  588  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.293627  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0645  polyprenyl synthetase family protein  99.66 
 
 		 297 aa  587  1e-166  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0989219  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1389  polyprenyl synthetase family protein  98.65 
 
 		 297 aa  581  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0771  polyprenyl-diphosphate synthase  66.33 
 
 		 297 aa  378  1e-104  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0687  polyprenyl synthetase  60.61 
 
 		 294 aa  342  5e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.169435  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0895  bifunctional short chain isoprenyl diphosphate synthase  61.28 
 
 		 297 aa  340  2e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224244  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0763  prenyl transferase  59.6 
 
 		 297 aa  337  9.999999999999999e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00222564  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1327  Polyprenyl synthetase  50.51 
 
 		 298 aa  277  1e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000397388  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0858  polyprenyl synthetase  48.48 
 
 		 295 aa  269  4e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.271141  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  34.06 
 
 		 358 aa  165  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  33.94 
 
 		 340 aa  163  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  33.94 
 
 		 351 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  33.94 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  35.53 
 
 		 334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  37.33 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  34.57 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  34.55 
 
 		 334 aa  159  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  34.81 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  34.75 
 
 		 313 aa  159  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  34.91 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  35.23 
 
 		 323 aa  158  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  34.55 
 
 		 323 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  34.55 
 
 		 323 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  34.55 
 
 		 323 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  34.55 
 
 		 323 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  33.82 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  34.55 
 
 		 323 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  34.55 
 
 		 323 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  34.55 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  34.55 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  34.55 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  34.55 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  34.55 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  34.55 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  40.69 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  38.43 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  40 
 
 		 323 aa  155  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  37.07 
 
 		 322 aa  155  8e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  35.34 
 
 		 341 aa  155  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  34.81 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  35.15 
 
 		 323 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  42.7 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  36.72 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  41.95 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.04 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  38.25 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  35.8 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  35.79 
 
 		 326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  38.26 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  34.93 
 
 		 323 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  31.44 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  32.74 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  30.86 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  36.14 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  39.15 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  39.15 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  39.15 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  39.15 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  33.67 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  33.67 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  42.29 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  32.99 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  38.7 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  32.16 
 
 		 337 aa  149  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  33.67 
 
 		 322 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  35.74 
 
 		 327 aa  149  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  32.89 
 
 		 322 aa  149  8e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  30.19 
 
 		 336 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2658  Polyprenyl synthetase  37.11 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0590185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  36.98 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.56 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  31.27 
 
 		 336 aa  146  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.92 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  31.64 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.1 
 
 		 325 aa  146  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  31.7 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  32.26 
 
 		 360 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0968  polyprenyl synthetase  39.34 
 
 		 313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  34.59 
 
 		 345 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  37.6 
 
 		 325 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  38.17 
 
 		 325 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  38.73 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  38.26 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  29.73 
 
 		 322 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0722  polyprenyl synthetase  32.05 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.32 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  33.7 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  34.44 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  32.4 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  34.47 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  31.8 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  31.29 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  34.39 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  32.4 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0550  polyprenyl synthetase  44.13 
 
 		 331 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400591  normal  0.0346751 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0098  trans-hexaprenyltranstransferase  44.13 
 
 		 331 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000478178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  30.72 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0580  trans-hexaprenyltranstransferase  44.13 
 
 		 331 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478477  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  36.27 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>