More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2359 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2351  polyprenyl synthetase  99.74 
 
 		 386 aa  770    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.777136 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2359  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 386 aa  771    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.852076  normal  0.554984 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2312  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 386 aa  771    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  38.31 
 
 		 336 aa  203  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1618  polyprenyl synthetase  48.73 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.399283 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0016  Polyprenyl synthetase  41.35 
 
 		 332 aa  187  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24479 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  40.91 
 
 		 364 aa  186  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  38.69 
 
 		 354 aa  175  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  40.51 
 
 		 349 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  36.93 
 
 		 347 aa  152  7e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  35.81 
 
 		 320 aa  142  7e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  35 
 
 		 326 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  31.72 
 
 		 317 aa  136  8e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  32.91 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  29.52 
 
 		 322 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  29.82 
 
 		 322 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  30.54 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  31.83 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  30.8 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  30.93 
 
 		 322 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  31.38 
 
 		 317 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  30.93 
 
 		 322 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.87 
 
 		 345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  29.52 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  34.32 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  30.75 
 
 		 322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  29.25 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  30.93 
 
 		 322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  36.24 
 
 		 370 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  36.24 
 
 		 370 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  36.24 
 
 		 370 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  36.24 
 
 		 370 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  36.24 
 
 		 370 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  32.04 
 
 		 324 aa  126  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  35.06 
 
 		 325 aa  126  7e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.75 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  28.82 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  37.33 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  30.15 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  37.44 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  30.72 
 
 		 322 aa  125  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  35.84 
 
 		 338 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  38.18 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  35.32 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  35.78 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  36.87 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  33.22 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  37.73 
 
 		 330 aa  124  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  33.22 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.52 
 
 		 322 aa  124  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  35.32 
 
 		 323 aa  123  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  35.32 
 
 		 323 aa  123  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  33.48 
 
 		 323 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  35.32 
 
 		 323 aa  123  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  35.32 
 
 		 323 aa  123  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  35.32 
 
 		 323 aa  123  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  35.43 
 
 		 295 aa  123  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  35.91 
 
 		 326 aa  123  6e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  30.42 
 
 		 322 aa  122  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  34.98 
 
 		 334 aa  122  9e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  30.03 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  35.55 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  28.83 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  36.15 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  29.55 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  34.96 
 
 		 296 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  29.82 
 
 		 322 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  33.64 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  35.11 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  35.62 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  36.32 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  35.27 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  28.83 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  36.32 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  36.32 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  29.64 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  28.83 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  37.84 
 
 		 332 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0978  trans-hexaprenyltranstransferase  31.29 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234439  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  32.95 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1909  Polyprenyl synthetase  31.55 
 
 		 332 aa  119  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0724132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  36.07 
 
 		 322 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  30.03 
 
 		 322 aa  119  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  33.2 
 
 		 295 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  30.14 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  30.84 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  35.4 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  34.86 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  31.79 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  35.95 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  33.2 
 
 		 295 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  28.83 
 
 		 324 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0894  trans-hexaprenyltranstransferase  37.05 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000238398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3126  trans-hexaprenyltranstransferase  37.05 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000273118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  31.14 
 
 		 323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3220  polyprenyl synthetase  37.05 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000594957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  35.85 
 
 		 333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  35.85 
 
 		 331 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  29.94 
 
 		 323 aa  117  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  35.81 
 
 		 327 aa  116  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>