More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0241 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0241  Polyprenyl synthetase  100 
 
 
280 aa  541  1e-153  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.362047 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1268  Polyprenyl synthetase  73.21 
 
 
281 aa  386  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.635974 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3335  Polyprenyl synthetase  68.93 
 
 
280 aa  351  8.999999999999999e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1426  Polyprenyl synthetase  67.14 
 
 
280 aa  348  6e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1385  Polyprenyl synthetase  70 
 
 
280 aa  345  6e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  34.01 
 
 
322 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  35.21 
 
 
306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  36.12 
 
 
327 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  33.33 
 
 
321 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  35.16 
 
 
322 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  33.11 
 
 
299 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  32.77 
 
 
299 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  35.14 
 
 
295 aa  143  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  28.75 
 
 
327 aa  142  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  33.78 
 
 
295 aa  142  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  33.45 
 
 
300 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  35.78 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  33.45 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  35.06 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  31.97 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  35.5 
 
 
323 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  32.77 
 
 
300 aa  138  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  32.77 
 
 
299 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  33.74 
 
 
324 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  35.98 
 
 
318 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  33.63 
 
 
325 aa  136  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  37.22 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  34.55 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  34.12 
 
 
320 aa  135  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  33.44 
 
 
300 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  32.18 
 
 
323 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  34.55 
 
 
323 aa  135  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  33.88 
 
 
331 aa  135  8e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  35 
 
 
323 aa  135  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  34.09 
 
 
333 aa  135  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  35 
 
 
331 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  34.5 
 
 
338 aa  134  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  35 
 
 
331 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  34.71 
 
 
327 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  35 
 
 
331 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.56 
 
 
323 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  35 
 
 
331 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  36.02 
 
 
356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.69 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  32.76 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.13 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  35.53 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  34.9 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  32.81 
 
 
321 aa  133  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  34.7 
 
 
334 aa  133  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  33.6 
 
 
317 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  36.41 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  33.2 
 
 
317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  35.59 
 
 
328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  35.43 
 
 
325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  33.2 
 
 
317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  33.18 
 
 
323 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  34.68 
 
 
322 aa  132  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  32.2 
 
 
326 aa  132  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  34.13 
 
 
326 aa  132  9e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  31.19 
 
 
307 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  34.86 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  35.62 
 
 
345 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  30.41 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  37.02 
 
 
325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  36.68 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  36.36 
 
 
340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  36.54 
 
 
325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  31.98 
 
 
331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  33.94 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  29.75 
 
 
323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  33.33 
 
 
323 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  30.94 
 
 
320 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  33.05 
 
 
323 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  35.64 
 
 
322 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  35.32 
 
 
322 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  33.33 
 
 
323 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 
323 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  33.33 
 
 
323 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  33.33 
 
 
323 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  33.33 
 
 
323 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  33.33 
 
 
323 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  34.04 
 
 
322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  33.33 
 
 
323 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  33.33 
 
 
323 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  38.86 
 
 
332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  33.03 
 
 
323 aa  129  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  34.63 
 
 
322 aa  129  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2658  Polyprenyl synthetase  34.98 
 
 
325 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0590185  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  32.68 
 
 
320 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  32.57 
 
 
370 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  32.57 
 
 
370 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  32.57 
 
 
370 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  32.57 
 
 
370 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  32.57 
 
 
370 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  30.61 
 
 
309 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  30.61 
 
 
309 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  33.17 
 
 
323 aa  128  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  33.22 
 
 
297 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  33.03 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>