More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1426 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1426  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 280 aa  547  1e-155  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1268  Polyprenyl synthetase  76.07 
 
 		 281 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.635974 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0241  Polyprenyl synthetase  67.14 
 
 		 280 aa  361  6e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362047 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1385  Polyprenyl synthetase  69.64 
 
 		 280 aa  345  6e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3335  Polyprenyl synthetase  65.36 
 
 		 280 aa  334  9e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  34.01 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  40.09 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  32.11 
 
 		 294 aa  142  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  32.31 
 
 		 300 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  34.06 
 
 		 334 aa  142  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  37.67 
 
 		 299 aa  142  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  32.31 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  32.38 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  32.23 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  38.25 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  31.56 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  32.31 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  32.65 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  32.65 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  36.18 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  32.99 
 
 		 299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2658  Polyprenyl synthetase  38.33 
 
 		 325 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0590185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  34.24 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  39.69 
 
 		 359 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  32.65 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  33.89 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  32 
 
 		 317 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  32.64 
 
 		 317 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  31.25 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  38.14 
 
 		 345 aa  135  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  31.4 
 
 		 317 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  32.87 
 
 		 317 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  30.43 
 
 		 297 aa  135  8e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  34.41 
 
 		 323 aa  135  9e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  34.95 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  31.85 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  33.91 
 
 		 326 aa  134  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  30.67 
 
 		 316 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  33.82 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  32.02 
 
 		 331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  34.14 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  32.42 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  34.72 
 
 		 322 aa  132  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  32.74 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.72 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  30.64 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  35.27 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  36.53 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3450  Polyprenyl synthetase  40.59 
 
 		 330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024256  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  34.39 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  31.14 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  33.49 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  34.13 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  34.39 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0506  octylprenyl-diphosphate synthase  40.59 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282953  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  37.11 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  33.68 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  31.36 
 
 		 323 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  32.41 
 
 		 326 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  31.16 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  29.72 
 
 		 321 aa  129  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  33.56 
 
 		 299 aa  129  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  32.66 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  34.4 
 
 		 332 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  38.43 
 
 		 325 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  33.33 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  32.56 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  34 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  35 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  35 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  35 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  35 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  31.5 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1707  polyprenyl synthetase  36.67 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219541  normal  0.533625 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  38.61 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  35 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  35 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  33.56 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  33.22 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  35 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  34.8 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  35.38 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  35 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  35 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  35 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  33.85 
 
 		 320 aa  126  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  32.43 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  35.65 
 
 		 334 aa  126  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  35.44 
 
 		 338 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  34.98 
 
 		 323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  28.71 
 
 		 327 aa  126  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  33 
 
 		 348 aa  126  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  31.99 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  35.19 
 
 		 336 aa  125  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0955  Polyprenyl synthetase  37.7 
 
 		 306 aa  125  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  33.33 
 
 		 322 aa  125  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  33.5 
 
 		 323 aa  125  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  34.5 
 
 		 323 aa  125  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>