More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3335 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3335  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 280 aa  539  9.999999999999999e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1385  Polyprenyl synthetase  83.93 
 
 		 280 aa  415  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0241  Polyprenyl synthetase  68.93 
 
 		 280 aa  360  2e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362047 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1268  Polyprenyl synthetase  70 
 
 		 281 aa  354  7.999999999999999e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.635974 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1426  Polyprenyl synthetase  65.36 
 
 		 280 aa  334  7.999999999999999e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  39.07 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  36.58 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  33.78 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  34.11 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  35.9 
 
 		 323 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  32.77 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  32.67 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  32.43 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.48 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  32.77 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  32.21 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  30.41 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  35.25 
 
 		 299 aa  132  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  35.78 
 
 		 332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  31.44 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  39.29 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  31.94 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  35.29 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  31.75 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  33.46 
 
 		 327 aa  129  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  33.46 
 
 		 306 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  39.29 
 
 		 333 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  36.4 
 
 		 295 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  35.1 
 
 		 317 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  32.17 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  35.29 
 
 		 299 aa  126  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  37.76 
 
 		 323 aa  126  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  34.29 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  30.94 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  31.53 
 
 		 307 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  31.82 
 
 		 317 aa  125  6e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  34.51 
 
 		 327 aa  125  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  30.86 
 
 		 325 aa  125  8.000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  30.17 
 
 		 294 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4194  polyprenyl synthetase  40.37 
 
 		 349 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  31.53 
 
 		 332 aa  124  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  37.56 
 
 		 323 aa  124  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  38.78 
 
 		 331 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  31.58 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  33.21 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  38.78 
 
 		 331 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  34.24 
 
 		 320 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  35.94 
 
 		 318 aa  124  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  38.78 
 
 		 331 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  30 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  38.78 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1912  Polyprenyl synthetase  39.56 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  33.99 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  35.38 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  29.43 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  37.31 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  31.62 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  30.51 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  37 
 
 		 322 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  36.45 
 
 		 338 aa  123  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  34.47 
 
 		 296 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  30.99 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  33.08 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  30.17 
 
 		 337 aa  122  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  33.9 
 
 		 298 aa  122  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  31.41 
 
 		 294 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  37.41 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1707  polyprenyl synthetase  37.24 
 
 		 303 aa  122  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219541  normal  0.533625 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  35.11 
 
 		 323 aa  122  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  33.8 
 
 		 320 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  32.51 
 
 		 323 aa  122  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  34.26 
 
 		 322 aa  122  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  30.79 
 
 		 327 aa  122  7e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  33.11 
 
 		 297 aa  122  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1997  Polyprenyl synthetase  37.77 
 
 		 368 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0211657  normal  0.0925303 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  34.53 
 
 		 322 aa  122  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  30.45 
 
 		 327 aa  122  9e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  35.78 
 
 		 326 aa  122  9e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  32.93 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  32.63 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  32.51 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  32.31 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  32.51 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0483  Polyprenyl synthetase  39.19 
 
 		 343 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  32.51 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  32.51 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  32.51 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  37.63 
 
 		 340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  32.51 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  37.63 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  30.74 
 
 		 331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  35.81 
 
 		 356 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  32.17 
 
 		 322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  35.04 
 
 		 346 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  32.51 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2241  polyprenyl synthetase  35.15 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  0.0529545 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  32.51 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  32.51 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  32.87 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>