More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6665 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6665  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 338 aa  664    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6906  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  54.27 
 
 		 346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5714  polyprenyl synthetase  54.76 
 
 		 338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0822  polyprenyl synthetase  54.63 
 
 		 338 aa  298  7e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  49.09 
 
 		 346 aa  295  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23090  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  51.94 
 
 		 335 aa  294  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  51.07 
 
 		 346 aa  291  9e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  47.71 
 
 		 359 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1696  polyprenyl synthetase  57.27 
 
 		 339 aa  281  1e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000054414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3714  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  49.55 
 
 		 350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000327917  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4971  Polyprenyl synthetase  49.39 
 
 		 346 aa  249  7e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5921  Polyprenyl synthetase  47.13 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214743  normal  0.354023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1997  Polyprenyl synthetase  51.84 
 
 		 368 aa  236  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0211657  normal  0.0925303 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13417  polyprenyl synthetase idsB  44.38 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  39.21 
 
 		 338 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  40.12 
 
 		 338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  38.61 
 
 		 343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  36.81 
 
 		 326 aa  173  5e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  38.29 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  38.15 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4493  polyprenyl synthetase  37.11 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000291603  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  36.21 
 
 		 321 aa  160  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  33.79 
 
 		 322 aa  156  6e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  40.76 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  33.43 
 
 		 322 aa  149  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1465  Polyprenyl synthetase  36.64 
 
 		 345 aa  149  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  35.6 
 
 		 290 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  36.73 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.06 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2818  Polyprenyl synthetase  40.43 
 
 		 337 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  40.57 
 
 		 327 aa  143  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  32.76 
 
 		 317 aa  142  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  39.09 
 
 		 290 aa  142  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  30.43 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  31.99 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.03 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  37.02 
 
 		 320 aa  139  6e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.65 
 
 		 364 aa  139  6e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  37.14 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  30.86 
 
 		 322 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  41.98 
 
 		 294 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  35.07 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  31.97 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  31.36 
 
 		 317 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  37.41 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  38.31 
 
 		 358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  30.53 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  43.58 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  29.54 
 
 		 317 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  32.79 
 
 		 317 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  40.49 
 
 		 320 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  30.75 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  39.44 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.25 
 
 		 323 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  36.82 
 
 		 299 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  32.33 
 
 		 322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.92 
 
 		 345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  40.81 
 
 		 301 aa  133  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  33.93 
 
 		 348 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  32.68 
 
 		 321 aa  132  9e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  38.54 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  40.19 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  30.61 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  37.5 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  31.83 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  42.56 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  35.17 
 
 		 351 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  30.53 
 
 		 322 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  38.71 
 
 		 325 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  32.75 
 
 		 345 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  35.29 
 
 		 336 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  34.02 
 
 		 320 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  35.03 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  39.52 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  36.36 
 
 		 336 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  39.52 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  37.8 
 
 		 322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  32.97 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4378  Polyprenyl synthetase  38.14 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2749  polyprenyl synthetase  37.67 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0535555  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  32.52 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  35.39 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  34.9 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  37.13 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  38.21 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  36.08 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  34.84 
 
 		 322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  38.76 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.08 
 
 		 322 aa  126  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  39.71 
 
 		 299 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  36.07 
 
 		 336 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  35.25 
 
 		 336 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  29.01 
 
 		 323 aa  125  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  35.25 
 
 		 327 aa  125  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  32.5 
 
 		 324 aa  125  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  36.94 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  36.7 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  37.14 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  33.77 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  33.46 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>