More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1848 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 371 aa  744    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  63.11 
 
 		 374 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  63.11 
 
 		 374 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  63.4 
 
 		 374 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  58.45 
 
 		 1155 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  42.86 
 
 		 360 aa  230  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  43.32 
 
 		 353 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  41.26 
 
 		 358 aa  219  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  44.7 
 
 		 355 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  41.91 
 
 		 360 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  44.67 
 
 		 358 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  46.75 
 
 		 384 aa  209  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  38.79 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  38.9 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  47.98 
 
 		 634 aa  207  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  42.45 
 
 		 361 aa  205  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  40.62 
 
 		 359 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  41.8 
 
 		 375 aa  202  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  39.62 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  40.97 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  41.01 
 
 		 357 aa  200  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  38.1 
 
 		 362 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  38.44 
 
 		 376 aa  199  9e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  39.02 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  40.88 
 
 		 365 aa  196  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  39.03 
 
 		 356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  45.76 
 
 		 384 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  38.65 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  38.54 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  40.51 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  40.12 
 
 		 361 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  38.14 
 
 		 347 aa  179  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  38.36 
 
 		 359 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  38.36 
 
 		 359 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  38.36 
 
 		 359 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  39.63 
 
 		 372 aa  176  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  39.72 
 
 		 377 aa  169  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  37.03 
 
 		 364 aa  169  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  35.02 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.64 
 
 		 377 aa  169  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  39.35 
 
 		 385 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  37.97 
 
 		 350 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  34.2 
 
 		 364 aa  166  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  36.99 
 
 		 352 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  29.84 
 
 		 350 aa  160  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  41.06 
 
 		 380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  39.04 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  32.35 
 
 		 362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  36.13 
 
 		 418 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  36.13 
 
 		 418 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  36.13 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.9 
 
 		 373 aa  136  5e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  28.34 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  28.57 
 
 		 317 aa  126  6e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  28.25 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  27.92 
 
 		 317 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  26.05 
 
 		 320 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  26.67 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23090  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.62 
 
 		 335 aa  116  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  27.46 
 
 		 325 aa  113  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  23.28 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0822  polyprenyl synthetase  31.32 
 
 		 338 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.51 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  30.84 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  34.35 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.25 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  29.04 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  34.7 
 
 		 359 aa  103  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  27.21 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21240  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.98 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.28 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  25.44 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  30.51 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  32.76 
 
 		 338 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13417  polyprenyl synthetase idsB  30.6 
 
 		 350 aa  100  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  25.4 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5714  polyprenyl synthetase  29.47 
 
 		 338 aa  99.8  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  27.87 
 
 		 324 aa  99  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  31.32 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0970  Polyprenyl synthetase  33.21 
 
 		 366 aa  98.6  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0268682 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  25.08 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6906  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  34.39 
 
 		 346 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  25.66 
 
 		 332 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  26.22 
 
 		 324 aa  97.4  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  28.4 
 
 		 324 aa  96.7  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  32.24 
 
 		 346 aa  96.3  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  29.57 
 
 		 322 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.79 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  23.12 
 
 		 326 aa  95.9  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  22.92 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  30.49 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  32.14 
 
 		 346 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1696  polyprenyl synthetase  37.84 
 
 		 339 aa  95.1  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000054414 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  30.1 
 
 		 334 aa  94.4  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  29.94 
 
 		 339 aa  94  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.87 
 
 		 354 aa  93.6  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  23.58 
 
 		 324 aa  93.6  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  26.97 
 
 		 294 aa  93.2  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  30.5 
 
 		 328 aa  92.8  9e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2582  hypothetical protein  28.66 
 
 		 322 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>