More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0687 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0687  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 294 aa  577  1e-164  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.169435  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1389  polyprenyl synthetase family protein  60.94 
 
 		 297 aa  359  3e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0645  polyprenyl synthetase family protein  60.61 
 
 		 297 aa  357  9.999999999999999e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0989219  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0566  polyprenyl synthetase family protein  60.61 
 
 		 297 aa  357  9.999999999999999e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.293627  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0895  bifunctional short chain isoprenyl diphosphate synthase  60.61 
 
 		 297 aa  340  2e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224244  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0763  prenyl transferase  59.93 
 
 		 297 aa  336  2.9999999999999997e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00222564  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0771  polyprenyl-diphosphate synthase  56.57 
 
 		 297 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1327  Polyprenyl synthetase  53.54 
 
 		 298 aa  297  1e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000397388  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0858  polyprenyl synthetase  50.51 
 
 		 295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.271141  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  38.13 
 
 		 333 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  38.43 
 
 		 331 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  38.43 
 
 		 331 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  38.43 
 
 		 331 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  38.43 
 
 		 331 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  37.5 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  42.66 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  39.43 
 
 		 327 aa  170  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  36.19 
 
 		 323 aa  168  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  40 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  38.46 
 
 		 345 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  36.08 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  38.22 
 
 		 334 aa  166  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  42.29 
 
 		 327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  40.45 
 
 		 325 aa  165  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  35.41 
 
 		 323 aa  165  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  36.55 
 
 		 359 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  37.33 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  36.25 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  37.6 
 
 		 331 aa  163  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3450  Polyprenyl synthetase  41.75 
 
 		 330 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024256  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  34.07 
 
 		 337 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  33.82 
 
 		 341 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  37.3 
 
 		 322 aa  162  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.55 
 
 		 324 aa  162  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  30.55 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0506  octylprenyl-diphosphate synthase  41.75 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282953  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  36.27 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  34.38 
 
 		 343 aa  161  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  34.68 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  35.34 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  32.14 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  36.17 
 
 		 322 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  38.29 
 
 		 322 aa  159  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  37.61 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  31.79 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  39.53 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  36.17 
 
 		 322 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  36.17 
 
 		 322 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  36.47 
 
 		 322 aa  158  9e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2658  Polyprenyl synthetase  40 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0590185  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3653  octaprenyl-diphosphate synthase  38.43 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.17 
 
 		 322 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0894  trans-hexaprenyltranstransferase  38.04 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000238398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3126  trans-hexaprenyltranstransferase  38.34 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000273118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  34.12 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3220  polyprenyl synthetase  38.04 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000594957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  35.29 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  35.69 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  37.39 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  38.64 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  35.59 
 
 		 317 aa  156  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  31.43 
 
 		 323 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  34.03 
 
 		 338 aa  155  6e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  30.53 
 
 		 322 aa  155  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  29.18 
 
 		 333 aa  155  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2653  polyprenyl synthetase  37.77 
 
 		 330 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00415418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  37.9 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  37.73 
 
 		 331 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0508  polyprenyl synthetase  40 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000945867  normal  0.644632 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0550  polyprenyl synthetase  40 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400591  normal  0.0346751 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0098  trans-hexaprenyltranstransferase  40 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000478178  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0483  trans-hexaprenyltranstransferase  40 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000223454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0580  trans-hexaprenyltranstransferase  40 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478477  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3257  octaprenyl-diphosphate synthase  42.02 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3527  octaprenyl-diphosphate synthase  42.02 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0447  octaprenyl-diphosphate synthase  42.02 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2524  octaprenyl-diphosphate synthase  42.02 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0921642  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1306  octaprenyl-diphosphate synthase  42.02 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3491  octaprenyl-diphosphate synthase  42.02 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  34.75 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  34.14 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3524  octaprenyl-diphosphate synthase  42.02 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3665  trans-hexaprenyltranstransferase  40 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000484392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2803  polyprenyl synthetase  40 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000673013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  34.62 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  35.11 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1139  octaprenyl-diphosphate synthase  42.02 
 
 		 330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  38.1 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  34.36 
 
 		 340 aa  153  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0978  trans-hexaprenyltranstransferase  36.76 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234439  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  35.29 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  35.29 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  35.29 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  35.29 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  35.29 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  36.05 
 
 		 313 aa  152  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0658  polyprenyl synthetase  40.21 
 
 		 341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.586121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  34.45 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  33.73 
 
 		 336 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  35.16 
 
 		 332 aa  152  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>