More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0771 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0771  polyprenyl-diphosphate synthase  100 
 
 		 297 aa  595  1e-169  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1389  polyprenyl synthetase family protein  66.33 
 
 		 297 aa  397  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0645  polyprenyl synthetase family protein  66.33 
 
 		 297 aa  397  1e-109  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0989219  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0566  polyprenyl synthetase family protein  66.33 
 
 		 297 aa  397  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.293627  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0895  bifunctional short chain isoprenyl diphosphate synthase  59.26 
 
 		 297 aa  331  7.000000000000001e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224244  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0763  prenyl transferase  58.59 
 
 		 297 aa  323  2e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00222564  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0687  polyprenyl synthetase  56.57 
 
 		 294 aa  315  6e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.169435  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0858  polyprenyl synthetase  51.52 
 
 		 295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.271141  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1327  Polyprenyl synthetase  52.86 
 
 		 298 aa  275  7e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000397388  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  41.31 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  36.19 
 
 		 327 aa  159  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  38.08 
 
 		 334 aa  156  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  39.91 
 
 		 345 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  37.12 
 
 		 327 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  37.24 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  38.91 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  36.68 
 
 		 327 aa  152  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  32.88 
 
 		 342 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  38.73 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  37.83 
 
 		 359 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  39.25 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  33.81 
 
 		 344 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  39.15 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  35.09 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  39.06 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  34.94 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  40.5 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  31.02 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  38.68 
 
 		 323 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  38.68 
 
 		 323 aa  149  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  38.68 
 
 		 323 aa  149  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  32.48 
 
 		 322 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  38.68 
 
 		 323 aa  149  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  38.68 
 
 		 323 aa  149  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  38.68 
 
 		 323 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  32.62 
 
 		 317 aa  149  5e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  30.39 
 
 		 323 aa  149  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  33.45 
 
 		 337 aa  149  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  38.6 
 
 		 358 aa  149  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3524  octaprenyl-diphosphate synthase  42.25 
 
 		 330 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  40.39 
 
 		 322 aa  149  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  38.68 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3527  octaprenyl-diphosphate synthase  42.25 
 
 		 332 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3257  octaprenyl-diphosphate synthase  42.25 
 
 		 330 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2524  octaprenyl-diphosphate synthase  42.25 
 
 		 330 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0921642  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3491  octaprenyl-diphosphate synthase  42.25 
 
 		 330 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1306  octaprenyl-diphosphate synthase  42.25 
 
 		 330 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0447  octaprenyl-diphosphate synthase  42.25 
 
 		 330 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  37.79 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  29.9 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1139  octaprenyl-diphosphate synthase  42.25 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  32.48 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  34.21 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2803  polyprenyl synthetase  43.14 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000673013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3665  trans-hexaprenyltranstransferase  43.14 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000484392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0550  polyprenyl synthetase  43.14 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400591  normal  0.0346751 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0508  polyprenyl synthetase  43.14 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000945867  normal  0.644632 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.32 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0098  trans-hexaprenyltranstransferase  43.14 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000478178  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0483  trans-hexaprenyltranstransferase  43.14 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000223454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0580  trans-hexaprenyltranstransferase  43.14 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478477  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  42.08 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  38.81 
 
 		 370 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  38.81 
 
 		 370 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  38.81 
 
 		 370 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  38.81 
 
 		 370 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  40 
 
 		 322 aa  146  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  33.07 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  38.81 
 
 		 370 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  42.08 
 
 		 322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  31.39 
 
 		 322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  36.8 
 
 		 323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  36.02 
 
 		 323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3676  trans-hexaprenyltranstransferase  37.99 
 
 		 344 aa  146  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1137  trans-hexaprenyltranstransferase  40.1 
 
 		 323 aa  146  5e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  30.85 
 
 		 323 aa  146  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3450  Polyprenyl synthetase  41.18 
 
 		 330 aa  145  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024256  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0506  octylprenyl-diphosphate synthase  41.18 
 
 		 330 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282953  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  31.39 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  33.98 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1320  trans-hexaprenyltranstransferase  39.34 
 
 		 323 aa  145  8.000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195026  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.77 
 
 		 322 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  31.39 
 
 		 322 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  40.29 
 
 		 323 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  32.44 
 
 		 340 aa  145  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  35.68 
 
 		 331 aa  145  9e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0858  solanesyl diphosphate synthase  38.22 
 
 		 323 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0128707  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  35.02 
 
 		 323 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  34.82 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  39.6 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0658  polyprenyl synthetase  39.42 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.586121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  39.6 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  39.6 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  39.6 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  40.2 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  32.05 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  39.9 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  34.6 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  31.21 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  32.62 
 
 		 337 aa  143  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>