More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0763 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0763  prenyl transferase  100 
 
 
297 aa  603  1.0000000000000001e-171  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00222564  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1389  polyprenyl synthetase family protein  59.6 
 
 
297 aa  357  9.999999999999999e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0645  polyprenyl synthetase family protein  59.6 
 
 
297 aa  355  3.9999999999999996e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0989219  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0566  polyprenyl synthetase family protein  59.6 
 
 
297 aa  355  3.9999999999999996e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.293627  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0895  bifunctional short chain isoprenyl diphosphate synthase  60.61 
 
 
297 aa  347  1e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224244  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0687  polyprenyl synthetase  59.93 
 
 
294 aa  342  5e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.169435  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0771  polyprenyl-diphosphate synthase  58.59 
 
 
297 aa  323  2e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1327  Polyprenyl synthetase  53.54 
 
 
298 aa  301  8.000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000397388  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0858  polyprenyl synthetase  49.16 
 
 
295 aa  277  1e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.271141  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3450  Polyprenyl synthetase  40.32 
 
 
330 aa  158  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024256  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0506  octylprenyl-diphosphate synthase  40.32 
 
 
330 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282953  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  42.79 
 
 
322 aa  155  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  35.69 
 
 
322 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  37.39 
 
 
323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  39.71 
 
 
334 aa  152  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0550  polyprenyl synthetase  39.52 
 
 
331 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400591  normal  0.0346751 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0098  trans-hexaprenyltranstransferase  39.52 
 
 
331 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000478178  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  36.4 
 
 
326 aa  152  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0580  trans-hexaprenyltranstransferase  39.52 
 
 
331 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478477  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0508  polyprenyl synthetase  40.66 
 
 
331 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000945867  normal  0.644632 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  40.83 
 
 
321 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21410  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.25 
 
 
324 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.242583  hitchhiker  0.0000164953 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0912  Polyprenyl synthetase  36.23 
 
 
312 aa  150  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0418451  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0483  trans-hexaprenyltranstransferase  40.66 
 
 
331 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000223454  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  38.5 
 
 
325 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2803  polyprenyl synthetase  40.66 
 
 
331 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000673013  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3665  trans-hexaprenyltranstransferase  39.11 
 
 
331 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000484392  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  37.61 
 
 
332 aa  149  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  36.8 
 
 
333 aa  149  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0447  octaprenyl-diphosphate synthase  40.28 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3491  octaprenyl-diphosphate synthase  40.28 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1306  octaprenyl-diphosphate synthase  40.28 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3257  octaprenyl-diphosphate synthase  40.28 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2524  octaprenyl-diphosphate synthase  40.28 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0921642  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3524  octaprenyl-diphosphate synthase  40.28 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  37.22 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3527  octaprenyl-diphosphate synthase  40.28 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  38.76 
 
 
334 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  37.5 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2653  polyprenyl synthetase  42.94 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00415418  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  37.22 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  37.22 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  37.22 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  37.22 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  37.22 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1139  octaprenyl-diphosphate synthase  40.28 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  37.22 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  37.22 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  37.22 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  32.75 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  33.23 
 
 
356 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  34.54 
 
 
323 aa  146  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  37.22 
 
 
370 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  37.22 
 
 
370 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  37.22 
 
 
370 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  37.22 
 
 
370 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  37.22 
 
 
370 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  36.17 
 
 
323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  33.57 
 
 
340 aa  146  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  36.14 
 
 
323 aa  146  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  37.07 
 
 
322 aa  145  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  37.61 
 
 
332 aa  145  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  36.49 
 
 
327 aa  145  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  33.57 
 
 
340 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  40.98 
 
 
327 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  34.25 
 
 
322 aa  145  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  37.39 
 
 
322 aa  145  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  36.97 
 
 
323 aa  145  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  36.6 
 
 
331 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  36.6 
 
 
331 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  30.62 
 
 
338 aa  145  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  36.6 
 
 
331 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  35.71 
 
 
323 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2658  Polyprenyl synthetase  38.97 
 
 
325 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0590185  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  36.6 
 
 
331 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  38.25 
 
 
325 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  29.21 
 
 
337 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  34.18 
 
 
333 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  40 
 
 
322 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  32.58 
 
 
328 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  40.2 
 
 
345 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  34.29 
 
 
348 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  38.46 
 
 
322 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  32.37 
 
 
340 aa  143  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  39.27 
 
 
323 aa  144  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.96 
 
 
325 aa  143  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  33.61 
 
 
326 aa  143  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  35.96 
 
 
323 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  31.71 
 
 
358 aa  142  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  35.81 
 
 
327 aa  142  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  35.96 
 
 
323 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  30.85 
 
 
337 aa  142  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  35.96 
 
 
323 aa  142  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.75 
 
 
324 aa  142  8e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  38.39 
 
 
323 aa  142  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  32.81 
 
 
323 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  30.91 
 
 
322 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2084  Polyprenyl synthetase  34.68 
 
 
326 aa  141  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.235717  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  39.02 
 
 
322 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  39.9 
 
 
322 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>