More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1327 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1327  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 298 aa  600  1.0000000000000001e-171  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000397388  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0687  polyprenyl synthetase  53.54 
 
 		 294 aa  298  7e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.169435  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0895  bifunctional short chain isoprenyl diphosphate synthase  54.55 
 
 		 297 aa  296  3e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224244  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0763  prenyl transferase  53.54 
 
 		 297 aa  295  8e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00222564  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1389  polyprenyl synthetase family protein  50.51 
 
 		 297 aa  293  2e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0645  polyprenyl synthetase family protein  50.51 
 
 		 297 aa  292  5e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0989219  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0566  polyprenyl synthetase family protein  50.51 
 
 		 297 aa  292  6e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.293627  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0771  polyprenyl-diphosphate synthase  52.86 
 
 		 297 aa  271  8.000000000000001e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0858  polyprenyl synthetase  49.83 
 
 		 295 aa  266  4e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.271141  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  45.23 
 
 		 333 aa  155  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  37.11 
 
 		 331 aa  155  8e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  44.72 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.79 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  43.81 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  37.72 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  37.37 
 
 		 323 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  40 
 
 		 327 aa  148  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  42.11 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3450  Polyprenyl synthetase  42.08 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024256  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0508  polyprenyl synthetase  43 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000945867  normal  0.644632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0506  octylprenyl-diphosphate synthase  42.08 
 
 		 330 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282953  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0098  trans-hexaprenyltranstransferase  43 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000478178  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2803  polyprenyl synthetase  43 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000673013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  35.69 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0483  trans-hexaprenyltranstransferase  43 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000223454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0580  trans-hexaprenyltranstransferase  43 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478477  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0550  polyprenyl synthetase  43 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400591  normal  0.0346751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  38.57 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3665  trans-hexaprenyltranstransferase  43 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000484392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  40 
 
 		 322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  33.46 
 
 		 337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0968  polyprenyl synthetase  41.21 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05420  polyprenyl synthetase  38.79 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.242903  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  44.33 
 
 		 323 aa  146  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1139  octaprenyl-diphosphate synthase  42.16 
 
 		 330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2524  octaprenyl-diphosphate synthase  42.16 
 
 		 330 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0921642  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0447  octaprenyl-diphosphate synthase  42.16 
 
 		 330 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  37.28 
 
 		 359 aa  145  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3491  octaprenyl-diphosphate synthase  42.16 
 
 		 330 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133442  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3257  octaprenyl-diphosphate synthase  42.16 
 
 		 330 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2653  polyprenyl synthetase  42.62 
 
 		 330 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00415418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1306  octaprenyl-diphosphate synthase  42.16 
 
 		 330 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3524  octaprenyl-diphosphate synthase  42.16 
 
 		 330 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3527  octaprenyl-diphosphate synthase  42.16 
 
 		 332 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  39.15 
 
 		 322 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  39.13 
 
 		 323 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  39.13 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  34.88 
 
 		 341 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  39.13 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  42.71 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  39.9 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  39.33 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  36.05 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  40.1 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  39.42 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  38.28 
 
 		 325 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  38.86 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0374  solanesyl diphosphate synthase  38.96 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0383  solanesyl diphosphate synthase  38.96 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  36.32 
 
 		 327 aa  143  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  39.61 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  39.61 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0858  solanesyl diphosphate synthase  38.96 
 
 		 323 aa  143  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0128707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  39.61 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  39.61 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  39.61 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  39.61 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  39.61 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3220  polyprenyl synthetase  39.3 
 
 		 331 aa  143  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000594957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  39.61 
 
 		 323 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  42.21 
 
 		 323 aa  142  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  30 
 
 		 338 aa  142  7e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  37.8 
 
 		 323 aa  142  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  39.06 
 
 		 323 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  37.82 
 
 		 342 aa  142  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  38.76 
 
 		 323 aa  142  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  40.7 
 
 		 322 aa  142  9e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0894  trans-hexaprenyltranstransferase  39.1 
 
 		 331 aa  142  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000238398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  39.71 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  38.14 
 
 		 358 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  38.36 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51700  chloroplast Clp protease, subunit of ClpP peptidase complex  36.92 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.653243  hitchhiker  0.00209917 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0458  polyprenyl synthetase  36.19 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.480075 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1909  Polyprenyl synthetase  44.5 
 
 		 332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0724132  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  39.41 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  39.9 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3126  trans-hexaprenyltranstransferase  44.13 
 
 		 331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000273118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  40.67 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  40.58 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  40.67 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  34.69 
 
 		 344 aa  140  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  40.37 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  40.67 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  36.09 
 
 		 322 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  33.09 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  36.65 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>