More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4379 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4379  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 557 aa  1065    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  32.23 
 
 		 322 aa  154  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  34.68 
 
 		 330 aa  152  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  30.5 
 
 		 326 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  37.25 
 
 		 294 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  33.02 
 
 		 327 aa  145  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  32.78 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  33.67 
 
 		 313 aa  143  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  30.72 
 
 		 334 aa  143  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.89 
 
 		 322 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  32.55 
 
 		 321 aa  141  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  31.88 
 
 		 322 aa  141  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  33.33 
 
 		 321 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  39.92 
 
 		 295 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.29 
 
 		 345 aa  140  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  32.46 
 
 		 327 aa  140  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  30.98 
 
 		 337 aa  139  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  39.48 
 
 		 290 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  30.64 
 
 		 322 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  32.89 
 
 		 322 aa  139  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  31.33 
 
 		 327 aa  138  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1465  Polyprenyl synthetase  34.13 
 
 		 345 aa  137  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  30.2 
 
 		 322 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  31.19 
 
 		 332 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  30.56 
 
 		 348 aa  136  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 322 aa  136  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  32.99 
 
 		 322 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.05 
 
 		 322 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5924  Trans-hexaprenyltranstransferase  39.02 
 
 		 323 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  34.95 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21410  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.38 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.242583  hitchhiker  0.0000164953 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  30.39 
 
 		 320 aa  135  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  29.93 
 
 		 331 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  28.61 
 
 		 334 aa  134  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  33.79 
 
 		 333 aa  134  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  39.58 
 
 		 296 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  30.34 
 
 		 323 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.12 
 
 		 322 aa  133  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 325 aa  133  9e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  28.28 
 
 		 338 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  30.54 
 
 		 322 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  28.75 
 
 		 317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  30.17 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  31.03 
 
 		 323 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  30.69 
 
 		 323 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  31.42 
 
 		 332 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  33.55 
 
 		 320 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  29.66 
 
 		 323 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  40.83 
 
 		 294 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  30.4 
 
 		 325 aa  131  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  31.55 
 
 		 344 aa  131  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  31.56 
 
 		 327 aa  131  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  35.93 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  29.19 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  28.84 
 
 		 317 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  31.41 
 
 		 322 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  29.83 
 
 		 332 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  30.34 
 
 		 323 aa  130  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  32.18 
 
 		 331 aa  130  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  35.89 
 
 		 299 aa  130  6e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  32.18 
 
 		 331 aa  130  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  32.18 
 
 		 331 aa  130  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  34.41 
 
 		 359 aa  130  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  29.17 
 
 		 332 aa  130  8.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  30.63 
 
 		 327 aa  130  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  27.13 
 
 		 317 aa  130  9.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  28.92 
 
 		 323 aa  130  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  38.36 
 
 		 294 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  29.69 
 
 		 317 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  38.36 
 
 		 294 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  38.36 
 
 		 294 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  30 
 
 		 317 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  32.4 
 
 		 333 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  31.75 
 
 		 322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  28.62 
 
 		 326 aa  129  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0658  polyprenyl synthetase  30.68 
 
 		 341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.586121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  39.39 
 
 		 294 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  35.42 
 
 		 300 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  32.3 
 
 		 337 aa  129  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  30.74 
 
 		 322 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2899  octaprenyl-diphosphate synthase  31.13 
 
 		 322 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2517  Polyprenyl synthetase  31.13 
 
 		 322 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  31.54 
 
 		 322 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  32.99 
 
 		 358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4051  polyprenyl synthetase  34.55 
 
 		 356 aa  128  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  35.48 
 
 		 299 aa  128  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3676  trans-hexaprenyltranstransferase  32.78 
 
 		 344 aa  128  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  31.75 
 
 		 322 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  30.77 
 
 		 323 aa  128  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  31.75 
 
 		 322 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  31.19 
 
 		 370 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  31.19 
 
 		 370 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  31.19 
 
 		 370 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  31.19 
 
 		 370 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  31.19 
 
 		 370 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  37.04 
 
 		 301 aa  127  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  39.46 
 
 		 294 aa  127  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  28.12 
 
 		 324 aa  127  6e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  28.81 
 
 		 320 aa  127  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  37.95 
 
 		 295 aa  127  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>