More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0165 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0165  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 334 aa  660    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1206  polyprenyl synthetase  84.73 
 
 		 334 aa  578  1e-164  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.513986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0181  polyprenyl synthetase  81.74 
 
 		 334 aa  549  1e-155  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.375352 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0150  polyprenyl synthetase  81.74 
 
 		 334 aa  541  1e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0637  polyprenyl synthetase  57.18 
 
 		 340 aa  370  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  47.09 
 
 		 337 aa  285  7e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  33.55 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  36.12 
 
 		 317 aa  152  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  39.71 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  33.88 
 
 		 324 aa  149  5e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  32.73 
 
 		 321 aa  149  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  32.79 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  35.31 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  35.64 
 
 		 317 aa  146  5e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  31.89 
 
 		 324 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  32.01 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  29.19 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  34.98 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  33.43 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  31.27 
 
 		 321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  31.58 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  29.82 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.5 
 
 		 320 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  35.42 
 
 		 324 aa  139  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  32.84 
 
 		 323 aa  139  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  29.5 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  31.92 
 
 		 336 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  30.99 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  31.6 
 
 		 336 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  31.13 
 
 		 324 aa  136  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  31.59 
 
 		 348 aa  135  7.000000000000001e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  29.41 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  31.6 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  32.79 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  28.88 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  31.56 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  31.6 
 
 		 336 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  36.09 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  30.94 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  31.85 
 
 		 332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  29.75 
 
 		 322 aa  133  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  30.56 
 
 		 324 aa  132  6.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  29.07 
 
 		 322 aa  132  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  31.37 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  31.19 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  33.45 
 
 		 346 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  29.03 
 
 		 324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  27.57 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  32.14 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.32 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  35.51 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  34.46 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  35.32 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  30.99 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  31.37 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.84 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1909  Polyprenyl synthetase  33.93 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0724132  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  29.57 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  35.11 
 
 		 346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  29.85 
 
 		 332 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  31.72 
 
 		 351 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 		 322 aa  129  6e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  31.8 
 
 		 334 aa  129  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  31.63 
 
 		 331 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.44 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  29.33 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  30.24 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  34.69 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  30.65 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  29.7 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  28.81 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  30.23 
 
 		 330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  28.22 
 
 		 322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  37.25 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  38.91 
 
 		 295 aa  126  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  28.96 
 
 		 322 aa  126  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1997  Polyprenyl synthetase  39.72 
 
 		 368 aa  126  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0211657  normal  0.0925303 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4194  polyprenyl synthetase  31.08 
 
 		 349 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  35.74 
 
 		 299 aa  126  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  33.45 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  28.25 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  30.49 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  30.28 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  30.9 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1037  farnesyl-diphosphate synthase  37.7 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  32.78 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  34.89 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  27.81 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  30.29 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  35.74 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  35.94 
 
 		 297 aa  124  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  29.17 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  30.82 
 
 		 334 aa  123  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2608  Polyprenyl synthetase  32.56 
 
 		 344 aa  123  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  0.754762 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.61 
 
 		 364 aa  123  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0406  Polyprenyl synthetase  31.86 
 
 		 349 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.772266  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  31.25 
 
 		 336 aa  123  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  29.97 
 
 		 340 aa  123  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0407  Polyprenyl synthetase  31.86 
 
 		 349 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  36.4 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>