More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1125 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 350 aa  698    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  36.03 
 
 		 358 aa  192  9e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  34.44 
 
 		 355 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  33.02 
 
 		 357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.85 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  33.87 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  33.74 
 
 		 356 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  31.71 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  35.64 
 
 		 353 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  37.5 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  38.46 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  31.83 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.15 
 
 		 362 aa  171  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  32.08 
 
 		 365 aa  172  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  31.11 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  32.19 
 
 		 359 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  31.72 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  34.12 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  35.03 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  31.1 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  38.66 
 
 		 634 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  31.91 
 
 		 359 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  30.81 
 
 		 376 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  35.23 
 
 		 377 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  29.84 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  34.26 
 
 		 327 aa  159  5e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  37.42 
 
 		 317 aa  159  6e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  34.5 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  34.07 
 
 		 359 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  35.39 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.86 
 
 		 364 aa  157  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  34.07 
 
 		 359 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  34.07 
 
 		 359 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  31.64 
 
 		 349 aa  156  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  32.04 
 
 		 341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  35.71 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  31.36 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  28.89 
 
 		 368 aa  153  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  29.69 
 
 		 1155 aa  153  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  34.53 
 
 		 327 aa  152  8e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  31.21 
 
 		 347 aa  149  7e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  31.18 
 
 		 362 aa  149  9e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  31.07 
 
 		 380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.29 
 
 		 354 aa  147  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.32 
 
 		 361 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  33.75 
 
 		 364 aa  146  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.44 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  34.23 
 
 		 361 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  28.12 
 
 		 326 aa  144  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  32.47 
 
 		 322 aa  142  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  30.1 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  32.39 
 
 		 362 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  31.08 
 
 		 385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  29.67 
 
 		 347 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  27.87 
 
 		 374 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  34.26 
 
 		 377 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  26.94 
 
 		 374 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  26.94 
 
 		 374 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  32.47 
 
 		 321 aa  136  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  30.1 
 
 		 352 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  30.49 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  27.81 
 
 		 377 aa  133  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0016  Polyprenyl synthetase  29.19 
 
 		 332 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  28.13 
 
 		 372 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  28.76 
 
 		 330 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  30.49 
 
 		 323 aa  129  9.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.8 
 
 		 373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  29.11 
 
 		 332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  30.07 
 
 		 323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  28.2 
 
 		 313 aa  127  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  29.84 
 
 		 323 aa  126  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  28.88 
 
 		 350 aa  126  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  32.25 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  32.45 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  28.43 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  29.51 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  30.12 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  29.15 
 
 		 336 aa  125  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  27.25 
 
 		 331 aa  124  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  29.13 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0970  Polyprenyl synthetase  29.54 
 
 		 366 aa  123  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0268682 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  28.62 
 
 		 382 aa  123  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  28.99 
 
 		 370 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  28.99 
 
 		 370 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  28.99 
 
 		 370 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  28.99 
 
 		 370 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  28.99 
 
 		 370 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  29.32 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  29.32 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  29.32 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  29.32 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  29.5 
 
 		 348 aa  122  9e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  29.32 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  25.22 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  29.32 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  28.99 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  31.34 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  31.67 
 
 		 299 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  27.54 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>