More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3331 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  100 
 
 
359 aa  703    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  100 
 
 
359 aa  703    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  100 
 
 
359 aa  703    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  79.67 
 
 
359 aa  564  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  76.6 
 
 
359 aa  546  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  69.03 
 
 
352 aa  437  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  51.69 
 
 
362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  47.49 
 
 
356 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  48.09 
 
 
376 aa  287  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  45.53 
 
 
361 aa  285  7e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  46.38 
 
 
360 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  49.35 
 
 
353 aa  264  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  46.87 
 
 
367 aa  259  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  46.38 
 
 
360 aa  253  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  45.24 
 
 
357 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  48.47 
 
 
358 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  46.04 
 
 
358 aa  250  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  42.16 
 
 
365 aa  249  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  46.79 
 
 
355 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  48.81 
 
 
377 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  46.51 
 
 
375 aa  243  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  45.99 
 
 
356 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  45.18 
 
 
360 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  44.41 
 
 
634 aa  231  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  45.16 
 
 
361 aa  229  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  41.19 
 
 
364 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  41.82 
 
 
380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  42.49 
 
 
377 aa  219  7e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  38.94 
 
 
364 aa  218  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  39.83 
 
 
362 aa  216  4e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  44.1 
 
 
384 aa  209  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  43.6 
 
 
372 aa  209  6e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  42.66 
 
 
369 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  45.45 
 
 
365 aa  205  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  43.79 
 
 
384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  38.81 
 
 
377 aa  190  4e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  41.07 
 
 
373 aa  189  5.999999999999999e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  42.07 
 
 
385 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  38.53 
 
 
362 aa  187  3e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  38.36 
 
 
371 aa  186  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  38.56 
 
 
374 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  38.56 
 
 
374 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  38.56 
 
 
374 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  39.05 
 
 
368 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  45.6 
 
 
362 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  38.29 
 
 
1155 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  37.61 
 
 
350 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  39.32 
 
 
418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  39.32 
 
 
418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  39.32 
 
 
418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  35.77 
 
 
350 aa  161  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  37.18 
 
 
347 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  30.26 
 
 
326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  29.17 
 
 
324 aa  129  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0970  Polyprenyl synthetase  34.7 
 
 
366 aa  129  9.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0268682 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  29.19 
 
 
368 aa  125  9e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.23 
 
 
382 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  26.27 
 
 
341 aa  122  9e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.45 
 
 
361 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.63 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  30.77 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  32.51 
 
 
324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  30.84 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  30.86 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  32.11 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  28.13 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  29.73 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  31.71 
 
 
317 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  28.35 
 
 
332 aa  110  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  29.1 
 
 
337 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0890  polyprenyl synthetase  30.06 
 
 
309 aa  109  8.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0253423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6906  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  33.21 
 
 
346 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  29.49 
 
 
332 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  30.43 
 
 
337 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  27.95 
 
 
320 aa  108  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  31.05 
 
 
317 aa  108  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  31.3 
 
 
317 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1756  trans-hexaprenyltranstransferase  29.58 
 
 
344 aa  107  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.726809  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21240  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.65 
 
 
358 aa  107  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  31.14 
 
 
322 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.95 
 
 
364 aa  107  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  28.72 
 
 
299 aa  107  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  23.97 
 
 
332 aa  106  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  28.38 
 
 
330 aa  106  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  30.84 
 
 
331 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  30.84 
 
 
331 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  30.84 
 
 
331 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.05 
 
 
323 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  32.37 
 
 
346 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 
346 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  30.42 
 
 
323 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.23 
 
 
325 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  30.69 
 
 
322 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1618  polyprenyl synthetase  37.08 
 
 
329 aa  103  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.399283 
 
 
-
 
NC_004310  BR1777  geranyltranstransferase  37.45 
 
 
304 aa  103  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.66005  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1126  polyprenyl synthetase  36.47 
 
 
304 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3126  trans-hexaprenyltranstransferase  30.52 
 
 
331 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000273118  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  30.45 
 
 
338 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  30.84 
 
 
333 aa  102  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  26.6 
 
 
321 aa  102  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>