More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5028 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 357 aa  709    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  60.91 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  60.91 
 
 		 360 aa  381  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  54.67 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  55.33 
 
 		 353 aa  328  8e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  49.72 
 
 		 361 aa  317  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  50.7 
 
 		 365 aa  310  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  50.92 
 
 		 355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  50.14 
 
 		 360 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  53.18 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  48.31 
 
 		 356 aa  293  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  50.61 
 
 		 358 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  49.86 
 
 		 359 aa  285  8e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  51.59 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  52.46 
 
 		 634 aa  282  8.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  44.03 
 
 		 362 aa  281  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  50 
 
 		 364 aa  279  5e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  52.74 
 
 		 375 aa  278  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  52.83 
 
 		 365 aa  276  5e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  47.16 
 
 		 359 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  50.56 
 
 		 364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  47.18 
 
 		 362 aa  262  8e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  47.72 
 
 		 372 aa  255  7e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  49.44 
 
 		 369 aa  250  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  46.4 
 
 		 359 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  46.4 
 
 		 359 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  46.4 
 
 		 359 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  47.42 
 
 		 377 aa  246  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  48.31 
 
 		 384 aa  239  5e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  44.19 
 
 		 362 aa  233  3e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  44.89 
 
 		 361 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  41.42 
 
 		 376 aa  229  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  44.22 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  44.99 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  44.25 
 
 		 350 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  43.75 
 
 		 368 aa  216  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  41.04 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  43 
 
 		 374 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  41.01 
 
 		 371 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  42.66 
 
 		 374 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  42.66 
 
 		 374 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.99 
 
 		 377 aa  209  5e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  44.62 
 
 		 377 aa  209  7e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  49.13 
 
 		 362 aa  202  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  43.03 
 
 		 373 aa  201  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  43.34 
 
 		 380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  43.57 
 
 		 1155 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  33.9 
 
 		 350 aa  185  9e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  36.44 
 
 		 418 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  36.44 
 
 		 418 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  36.44 
 
 		 418 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  39.16 
 
 		 385 aa  176  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.32 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.97 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  26.19 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  27.9 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  30.79 
 
 		 322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  32.07 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  32.76 
 
 		 327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  29.09 
 
 		 323 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  29.97 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  32.95 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  28.92 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.23 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  31.97 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  30.71 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  29.86 
 
 		 317 aa  113  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.58 
 
 		 345 aa  113  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  28.7 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0970  Polyprenyl synthetase  35.83 
 
 		 366 aa  112  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0268682 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.56 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  29.19 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  29.19 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  29.19 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  30.3 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  30.18 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  32.9 
 
 		 346 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  30.18 
 
 		 317 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  27.48 
 
 		 326 aa  110  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  29.09 
 
 		 323 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  29.7 
 
 		 323 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  29.7 
 
 		 323 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  29.7 
 
 		 323 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  29.7 
 
 		 323 aa  109  8.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  30 
 
 		 323 aa  109  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  29.7 
 
 		 323 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  29.7 
 
 		 323 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  30.99 
 
 		 313 aa  109  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  29.09 
 
 		 323 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  29.09 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  28.01 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  28.9 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  31.63 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21240  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  38.46 
 
 		 358 aa  107  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0658  polyprenyl synthetase  30.36 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.586121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  30.79 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  29.82 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  28.48 
 
 		 370 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  30.03 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  24.7 
 
 		 317 aa  107  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>