More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15850 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  100 
 
 		 369 aa  718    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  56.3 
 
 		 372 aa  342  9e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  53.74 
 
 		 365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  48.91 
 
 		 365 aa  291  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  50.43 
 
 		 364 aa  289  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  51.66 
 
 		 360 aa  288  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  48.35 
 
 		 367 aa  286  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  47.44 
 
 		 364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  49.86 
 
 		 357 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  46.61 
 
 		 360 aa  272  7e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  48.88 
 
 		 358 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  49.69 
 
 		 361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  51.38 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  46.11 
 
 		 368 aa  265  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  51.04 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  46.89 
 
 		 356 aa  259  6e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  44.29 
 
 		 362 aa  259  8e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  46.33 
 
 		 353 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  44.44 
 
 		 356 aa  247  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  43.66 
 
 		 355 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  48.48 
 
 		 373 aa  239  8e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  44.35 
 
 		 358 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  49.5 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  44.18 
 
 		 359 aa  229  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  47.09 
 
 		 375 aa  227  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  48.47 
 
 		 634 aa  226  7e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  41.76 
 
 		 359 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  44 
 
 		 362 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  42.98 
 
 		 359 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  42.98 
 
 		 359 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  42.98 
 
 		 359 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  46.75 
 
 		 377 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  40.54 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  42.86 
 
 		 376 aa  209  5e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  40.86 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  43.25 
 
 		 384 aa  195  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  41.05 
 
 		 352 aa  193  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  41.69 
 
 		 374 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  41.69 
 
 		 374 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  41.69 
 
 		 374 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  41.69 
 
 		 362 aa  192  8e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  37.91 
 
 		 347 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  38.62 
 
 		 1155 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  45.25 
 
 		 384 aa  185  9e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  44.44 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  39.66 
 
 		 385 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  37.99 
 
 		 350 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  42.45 
 
 		 380 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  35.46 
 
 		 350 aa  173  5e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  38.48 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  38.48 
 
 		 418 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  38.48 
 
 		 418 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.12 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.59 
 
 		 382 aa  133  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  34.9 
 
 		 336 aa  126  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  27.27 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  34.56 
 
 		 347 aa  122  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  27.7 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  30.7 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  30.55 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  29.32 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  29.02 
 
 		 332 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  30 
 
 		 364 aa  113  6e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  29.26 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  32.63 
 
 		 321 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0016  Polyprenyl synthetase  34.07 
 
 		 332 aa  109  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24479 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  30.18 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0970  Polyprenyl synthetase  35.53 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0268682 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1618  polyprenyl synthetase  35.98 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.399283 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  31.48 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3450  Polyprenyl synthetase  34.12 
 
 		 330 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024256  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  25.5 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  27.04 
 
 		 317 aa  106  8e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.45 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.38 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.92 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  24.58 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0506  octylprenyl-diphosphate synthase  34.12 
 
 		 330 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282953  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  33.05 
 
 		 338 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  32.91 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  27.4 
 
 		 317 aa  102  9e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  27.64 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2351  polyprenyl synthetase  33.2 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.777136 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  31.97 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2312  polyprenyl synthetase  33.2 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.73 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2359  polyprenyl synthetase  33.2 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.852076  normal  0.554984 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2653  polyprenyl synthetase  32.58 
 
 		 330 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00415418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  33.61 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  29.13 
 
 		 320 aa  100  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  29.97 
 
 		 338 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  32.88 
 
 		 342 aa  100  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  24.78 
 
 		 341 aa  99.8  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  31.33 
 
 		 323 aa  99.8  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  28.74 
 
 		 323 aa  99.8  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0771  polyprenyl-diphosphate synthase  25.7 
 
 		 297 aa  99.8  7e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  31.48 
 
 		 370 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  32.18 
 
 		 324 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  31.65 
 
 		 322 aa  99.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>