More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1344 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 358 aa  719    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  73.74 
 
 		 355 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  61.93 
 
 		 353 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  54.34 
 
 		 360 aa  359  5e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  54.85 
 
 		 356 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  54.74 
 
 		 365 aa  321  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  50.94 
 
 		 367 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  50.42 
 
 		 360 aa  298  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  50.29 
 
 		 357 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  50.69 
 
 		 360 aa  282  7.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  49.21 
 
 		 356 aa  276  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  45.83 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  45.14 
 
 		 359 aa  259  7e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  47.71 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  46.99 
 
 		 362 aa  256  4e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  51.03 
 
 		 634 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  44.09 
 
 		 359 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  45.53 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  45.53 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  45.53 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  44.85 
 
 		 364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  45.92 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  44.16 
 
 		 374 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  44.16 
 
 		 374 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  43.87 
 
 		 374 aa  235  8e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  47.92 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  41.64 
 
 		 362 aa  233  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  44.21 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  45.91 
 
 		 365 aa  225  9e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  45.25 
 
 		 371 aa  225  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  49.04 
 
 		 362 aa  218  8.999999999999998e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  41.67 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  43.8 
 
 		 377 aa  215  9e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  46.88 
 
 		 384 aa  215  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  44.94 
 
 		 361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  45.3 
 
 		 1155 aa  209  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  43.73 
 
 		 369 aa  208  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  43.61 
 
 		 373 aa  207  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  45.57 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  38.97 
 
 		 347 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  40.74 
 
 		 376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  39.09 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  40.34 
 
 		 350 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  35.78 
 
 		 350 aa  196  5.000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  41.04 
 
 		 377 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  38.26 
 
 		 368 aa  190  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  38.78 
 
 		 362 aa  189  5e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  37.99 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  46.96 
 
 		 380 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  38.49 
 
 		 418 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  38.49 
 
 		 418 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  38.49 
 
 		 418 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  31.07 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.06 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  36.01 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  32.28 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.85 
 
 		 345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  27.19 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  27.35 
 
 		 317 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  31.89 
 
 		 334 aa  123  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  32.2 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  33.33 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  29.93 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.11 
 
 		 360 aa  119  6e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  29.04 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  26.76 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  26.83 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  31.63 
 
 		 322 aa  116  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  33 
 
 		 359 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  34.08 
 
 		 336 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  27.98 
 
 		 317 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  27.81 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  32.67 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.52 
 
 		 361 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  32.3 
 
 		 313 aa  114  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  27.11 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  26.86 
 
 		 321 aa  113  6e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0840  trans-hexaprenyltranstransferase  32.08 
 
 		 327 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.24671  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  34.08 
 
 		 322 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  30.99 
 
 		 348 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  27.59 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  27.38 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  30.55 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0970  Polyprenyl synthetase  35.08 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0268682 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  32.69 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.72 
 
 		 320 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  33.12 
 
 		 325 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.22 
 
 		 322 aa  109  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  30.37 
 
 		 327 aa  109  8.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  30.09 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  30.13 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  31.53 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.71 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  27.74 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  30.13 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  30.07 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  30.9 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  30.13 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  31.83 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  29.3 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>