More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3312 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 347 aa  676    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  59.13 
 
 		 350 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  42.24 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  41.5 
 
 		 367 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  44.13 
 
 		 358 aa  225  7e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  39.66 
 
 		 365 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  42.86 
 
 		 375 aa  220  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  41.74 
 
 		 356 aa  216  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  40.79 
 
 		 353 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  40 
 
 		 361 aa  213  4.9999999999999996e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  39 
 
 		 362 aa  211  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  41.83 
 
 		 360 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  46.35 
 
 		 634 aa  210  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  40.06 
 
 		 364 aa  206  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  41.04 
 
 		 357 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  41.83 
 
 		 360 aa  203  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  39.22 
 
 		 364 aa  202  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  38.41 
 
 		 358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  41.35 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  37.5 
 
 		 355 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  43.15 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  38.14 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  38.56 
 
 		 374 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  38.56 
 
 		 374 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  38.56 
 
 		 374 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  38.16 
 
 		 356 aa  182  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  41.99 
 
 		 384 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  38.39 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  37.32 
 
 		 362 aa  177  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  37.39 
 
 		 1155 aa  176  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  40.69 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  37.86 
 
 		 359 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  36.68 
 
 		 372 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  39.68 
 
 		 365 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.91 
 
 		 369 aa  162  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  37.17 
 
 		 376 aa  162  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.21 
 
 		 377 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  38.83 
 
 		 385 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  37.18 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  37.18 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  37.18 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  37.7 
 
 		 352 aa  157  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  38.42 
 
 		 418 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  38.42 
 
 		 418 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  38.42 
 
 		 418 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  37.06 
 
 		 361 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  36.11 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  30.85 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  39.31 
 
 		 362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  37.19 
 
 		 380 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.84 
 
 		 373 aa  136  5e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  34.78 
 
 		 368 aa  129  8.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.3 
 
 		 364 aa  117  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0970  Polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0268682 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  30.69 
 
 		 349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21240  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.8 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.19 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  26.28 
 
 		 332 aa  109  6e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.44 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.38 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  31.68 
 
 		 334 aa  106  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  31.82 
 
 		 323 aa  105  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  31.92 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  26.97 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  30.62 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  30.92 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  30.43 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0658  polyprenyl synthetase  31 
 
 		 341 aa  103  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.586121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  30.54 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  27.68 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.01 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2653  polyprenyl synthetase  32.62 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00415418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  26.54 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  33 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  34.73 
 
 		 313 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  27.18 
 
 		 317 aa  99.8  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  30.74 
 
 		 324 aa  99.8  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  26.54 
 
 		 317 aa  99.4  8e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  31.02 
 
 		 323 aa  99.4  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  33.66 
 
 		 322 aa  99  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  30.68 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  30.85 
 
 		 322 aa  99  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.88 
 
 		 322 aa  99  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  30.77 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  30.77 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  31.3 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  29.43 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  30.77 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  30.77 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  27.7 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  30.26 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  34.29 
 
 		 330 aa  97.1  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  30.92 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  27.66 
 
 		 326 aa  96.7  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  31.76 
 
 		 351 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  31.13 
 
 		 333 aa  96.3  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  33.04 
 
 		 331 aa  96.3  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  31.8 
 
 		 297 aa  95.9  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  31.25 
 
 		 333 aa  95.9  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0687  polyprenyl synthetase  27.97 
 
 		 294 aa  96.3  8e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.169435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>